托發肛瘺。就是用補益氣血的藥物幫助正氣，防止有毒物質外泄，防止有毒物質內陷。此法適用於肛周膿腫的虛證，如正氣虛弱，毒邪過盛，不能托出有毒物質，肛周癰外觀扁平，根底足散，不易崩爛。如果毒氣旺盛但正氣不降，可使用透膿藥物，促使其盡快排膿，以減輕腫痛，避免膿液外泄，造成後患。
用法律消除肛瘺。主要用消散藥物消散初期的肛周癰和炎性外痔，避免膿腫和切口的疼痛。此法適用於肛周癰、炎性外痔、血栓性外痔、無膿腫的肛裂。但具體用法極其靈活，因為各種疾病的病因不壹樣，疾病的性質也不壹樣，所以治療方法也必須根據疾病而有所不同。若有表邪，則除表邪，除裏邪，除熱毒，溫寒邪，通氣滯，活血化瘀。同時要根據患者的體力和所屬經絡的不同，靈活治療癰。
加固肛瘺。主要用補藥恢復正氣，幫助患處再生，使瘡、瘺盡快愈合。此法適用於身體虛弱，氣血虛弱，潰瘍晚期，或肛腸疾病術後，熱毒已去，病竈已除，神疲乏力，元氣虛弱，膿液稀，傷口難愈的老年人，以及便血、脫肛患者。氣血虛弱者要補氣血，脾胃虛弱者要調理脾胃，肝腎不足者要滋補肝腎。但在毒素未盡時，不要過早用進補的方法，以免病邪內涵。
同時，肛瘺的發生與濕熱關系密切，所以濕熱油膩的食物要節制，同時要戒掉抽煙、喝酒、愛喝茶的習慣。多吃清淡、富含維生素的食物，如冬瓜、絲瓜、綠豆、蘿蔔等。
久治不愈的肛瘺多屬於虛損型，飲食上應多吃富含蛋白質的食物，如瘦肉、牛肉、香菇、大棗、芝麻等。此外，還有黑木耳、山藥、香菜、韭菜、茄子、芡實、菱角、蓮藕、茴香、荔枝、雞肉、羊肉、無花果等。
肛瘺治療秘方:
1，食療:綠豆薏米粥:綠豆20克，薏米20克，粳米50克。將綠豆、薏米分別洗凈，放入鍋中，加入清水500毫升，加入粳米，大火煮5分鐘，文火煮30分鐘做成粥，趁熱食用。能清熱利濕，主要用於治療肛瘺實證、大便幹燥。
2、小偏方:菊花6克，糖6克，綠茶3克，放入茶杯中用開水沖泡，略悶片刻，清淡淡雅，可清熱解毒，益血除濕，緩解肛瘺腫痛。
除了這些，肛瘺還有壹些簡單的小方法，比如坐浴，但是肛瘺不具備自愈的特性，只有手術才能徹底治療。其他的只是輔助治療，所以肛瘺要盡早手術治療。