肺脾氣虛，中氣不足。
黃芪主要入脾、肺經，有補中益氣、升陽之功。黃芪可用於肺脾兩虛，食少便溏，咳嗽氣短，神疲乏力，或氣不攝血，各種出血崩漏，子宮脫垂等患者。如果出現氣虛，人參、白術搭配好，增強補氣功效；大便稀，脾虛食少者，除黨參、白術外，常加茯苓、炒扁豆、炒薏苡仁健脾止瀉。治肺虛、咳嗽、氣喘、氣短、痰稀白者，常與黨參、茯苓、陳皮同用，或與人參、五味子、紫菀同用，以益氣斂肺，如雷勇錢芳補肺湯。如便血、吐血、崩漏等氣虛血不能吸收者，常與人參、當歸、桂圓等配伍益氣補血，見《顏氏濟生方》歸脾湯。
黃芪長於補氣升陽，故中氣下陷導致脫肛、子宮脫垂等臟腑疾病。黃芪是必備藥材。臨床上常與人參、白術、升麻、柴胡同用，以增強舉力，如脾胃學說中的補中益氣湯。現在在這個方子的基礎上，臨床上加了大劑量的枳殼，每次效果都不錯。
防禦不足自汗
黃芪有益氣固表止汗之功，與防風、白術同用，治虛勞自汗，如《丹溪心法》玉屏風散。它還可以與收斂和止汗藥物結合，如牡蠣和浮小麥，以增強止汗效果，如方菊的牡蠣粉。若氣虛陽弱多汗者，可配伍附子、生姜，以補益氣陽、固表止汗，如《顏氏方繼生》之芪唐宓。對於陰虛盜汗，也可以治療。宜與盛迪、黃精配伍，以滋陰瀉火，如石蘭密倉當歸黃流湯。
氣血不足所致瘡癰
黃芪具有補氣升陽、托毒生肌之功，有“瘡聖藥”之譽，故常用於氣血兩虛之瘡。若時間久了膿不潰，則與當歸、川芎、穿山甲、皂角同用。托毒排膿，就像正宗外科手術中的頭三浦。若潰瘍持續時間較長，則與當歸、人參、肉桂、熟地黃、白術等同用。益氣養血，養毒生肌，收口，如方菊的石全大補湯。如小兒痤瘡、虛脫氣虛者，可配伍人參、肉桂、炙甘草，益氣透疹，如《博鑒》保元湯。
四肢麻木和偏癱
黃芪補氣力強，能使血液旺盛。故氣血虛弱導致肢體麻木，半身不遂，可用黃芪治療，如《金匱要略》黃芪桂枝五物湯，即本品與桂枝、白芍、生姜、大棗配伍，以利溫經通絡，調和營衛，緩解痹痛；《益林改錯》補陽還五湯與當歸、川芎、桃仁同用治療中風偏癱。“101選方”蠲痹湯與羌活、防風、當歸等配伍。治療氣血不足的肩臂風濕痹痛。
水腫
黃芪具有利水消腫的作用，適用於脾虛濕阻所致的四肢面部水腫、小便不利。常與防風、白術等同用。如《金匱要略》中的季芳黃芪湯，用於治療慢性腎炎，效果良好。
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