腎囊腫的發展變化是壹個緩慢增長的過程。壹般來說，小於4cm的單純性腎囊腫對人體健康影響不大，不需要特殊治療，定期復查就夠了。
大於4cm的腎囊腫，由於體積較大，會擠壓周圍，造成腎臟損傷。可酌情采用腎囊腫穿刺註射硬化劑或腹腔鏡腎囊腫去頂術。
如果有血尿、蛋白尿、高血壓、腰腹部包塊或疼痛等癥狀，可以對癥治療。平時註意保護腎臟，慎用腎毒性較大的藥物。