在過去，需要通過外科手術移除病變的指甲；在患病的指甲被移除後，用碘酒去除真菌，直到新的指甲生長。目前，由於許多新藥的問世，口服藥物在治療灰指甲方面也取得了良好的效果。常用的藥物有:螺旋菌、曲安奈德、特比萘芬。