龜頭癬主要由真菌感染引起，偶爾伴有細菌繼發感染，常用藥物主要為抗真菌藥物，如唑類抗真菌藥物和丙烯酰胺類抗真菌藥物。
在龜頭炎的情況下，主要是由於包皮過長導致的清潔不當，而龜頭癬主要是由於免疫缺陷或免疫功能下降以及龜頭被真菌機會性感染所致。