獲得患者樣本後，應盡快進行檢測。如果樣品需要運輸到不能立即檢測的地方，要按照說明書和包裝送專門的檢測機構進行低溫檢測。檢測機構收到樣品後，應當從樣品中提取核酸，核酸提取試劑應當使用批準的產品說明書中規定的核酸提取試劑盒。
病毒RNA需要先轉錄成cDNA，再進行擴增和檢測。PCR擴增和檢測應使用批準的產品說明書中規定的熒光定量PCR儀。熒光定量PCR獲得的樣本Ct值可用於判斷患者樣本中是否含有新型冠狀病毒。
擴展數據:
目前，咽拭子主要用於臨床核酸檢測。步驟是讓受試者用淡鹽水漱口，去除口腔中的細菌，然後將標簽貼在標本容器上。
告知檢驗人員咽拭子培養的目的和方法，點亮酒精燈，打開檢驗人員采集的口腔、毛發和完全暴露的咽喉，將培養管長度的棉簽消毒至敏感並擦拭腭扁桃體弓和兩側咽部分泌物，取樣完畢，用酒精燈火焰消毒試管口，然後插入試管擦洗，插入後及時檢查。
核酸檢測是目前診斷病原體最重要的依據，也是診斷病原體的重要依據。例如，對於目前冠狀病毒肺炎-19的檢測，病毒核酸檢測仍然是診斷的金標準。