毛囊炎治療前，首先要明確毛囊炎感染的類型。不同類型的毛囊炎在治療上有很大的差異。有兩種常見的類型，真菌和細菌。真菌方面，最常見的馬拉色菌毛囊炎，常用酮康唑洗劑和布替萘芬軟膏，也可選用酮康唑乳膏。而且由於馬拉色菌容易寄生在油脂豐富的部位，所以可以配合藥物去油，如維生素B6片、丹參酮膠囊等，效果更好。如果單純應用效果不好，可以配合伊曲康唑膠囊口服治療。如果是細菌性的，建議外用聚維酮或百多邦軟膏，服用紅黴素腸溶膠囊，每天兩次。註意個人衛生，衣物消毒。
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