壹、甲類傳染病，包括鼠疫、霍亂。
二、乙類傳染病，包括傳染性非典型肺炎、艾滋病、病毒性肝炎、脊髓灰質炎、人感染高致病性禽流感、麻疹、流行性出血熱、狂犬病、流行性乙型腦炎、登革熱、炭疽、細菌性和阿米巴痢疾、肺結核、傷寒和副傷寒、流行性腦脊髓炎、百日咳、白喉、新生兒破傷風、猩紅熱、布氏桿菌病、淋病、梅毒、鉤端螺旋體病、血吸蟲病、瘧疾、人感染豬鏈球菌病、甲型H1N1流感。
三、丙類傳染病，包括流行性感冒、流行性腮腺炎、風疹、急性出血性結膜炎、麻風病、流行性和地方性斑疹傷寒、黑熱病及棘球蚴病、絲蟲病，除霍亂、痢疾、傷寒和副傷害以外的感染性腹瀉病、手足口病。