蒼耳子在中藥學中為發散風寒藥，其味辛、苦，性溫，有小毒，主入肺經，具有散風寒、通鼻竅、祛風濕、止痛的功效，臨床可用於治療風寒頭痛、鼻淵、鼻塞、流涕、風疹、瘙癢、濕痹拘攣等證。
但因蒼耳子有毒，臨床用量不宜大，否則容易中毒，出現腎臟損害、急性肝衰竭、腦水腫等嚴重後果，建議在醫師的指導下用藥。