現代藥理實驗表明，本品具有抗菌、抗病毒、增強免疫和利尿作用。臨床報道廣泛用於治療肺炎、咯血、上呼吸道感染、慢性支氣管炎、百日咳、流行性感冒、肺膿腫、癌性胸腔積液、感冒發熱、肺癌、宮頸糜爛、化膿性關節炎、習慣性便秘、急性細菌性痢疾、急性黃疸型肝炎、腎病綜合征、單純皰疹性角膜炎、鼻炎、化膿性中耳炎、腮腺炎、丘疹性蕁麻疹、慢性咽炎等。
魚腥草註射液是以魚腥草為主要成分的常用中成藥制劑，具有清熱解毒、利濕的作用，用於肺膿腫、痰熱咳嗽、白帶增多、尿路感染、癰癤等癥。又如復方魚腥草片(由魚腥草組成。黃芩、板藍根、連翹)，具有清熱解毒的作用，用於治療外感風熱引起的咽喉腫痛、扁桃體炎。
魚腥草制劑的不良反應很少。
幾個以魚腥草為主藥的方子
☆治肺膿腫:魚腥草30g。桔梗15g。，水煎或研末洗凈。
☆治痢疾:魚腥草20克，山楂炭6克，用蜂蜜煎服。
☆腮腺炎的治療方法:取新鮮魚腥草敷患處，搗碎，用膠布固定，每日兩次。
☆治療習慣性便秘:魚腥草5 ~ 10g，開水浸泡10 ~ 12分鐘供後人喝茶。治療期間停用其他藥物，10天為壹個療程。
☆急性黃疸型肝炎的治療:魚腥草180g，白糖30g，水煎，每日1劑，連續5 ~ 10劑。
☆腎病綜合征的治療:將魚腥草(幹品)100 ~ 150g用1000ml開水浸泡半小時，然後代茶飲用，每日1劑，3個月為壹個療程，療程間隔2 ~ 3天。
☆治療感冒發熱:將溪黃草20g、魚腥草16g水煎，或將上述藥物研成細粉，煎液濾液濃縮，與細粉混勻壓片，每片0.3g，每次3-4片，每日3次，小兒酌情服用。