腱鞘囊腫可以通過多種方法治療。擠破就能破，自己慢慢吸收。但是這種治療後有很多復發的情況，所以效果不是很理想。腱鞘囊腫的手術治療費用較高，且會長期影響患側關節的活動。
西醫認為本病多與關節或腱鞘的慢性勞損、機械刺激、外傷有關，而中醫認為腱鞘囊腫是由創傷性筋膜、邪氣、瘀滯、關節和經絡積水所致。所以目前廣泛使用針對腱鞘囊腫病因的活絡祛瘀中藥，安全方便，無毒副作用，很少復發。有些中藥膏藥藥物很受歡迎，大眾知道的口碑比較好的那種屬於千草堂的腱鞘貼，效果不錯。
腱鞘囊腫是反復摩擦引起的炎癥，壹定要註意患處的休息，生過病的人壹定要避免過度的體力勞動。電腦壹族要謹防腱鞘囊腫，工作時適當休息，經常做室內運動。腱鞘囊腫患者也要註意飲食，辛辣食物不宜多吃。