雍正初年，年羹堯成為新政權的核心人物，被視為國家重臣。年羹堯雖遠，雍正卻讓他參與朝政。在政務上，雍正經常征求年羹堯的意見。雍正給了年羹堯很大的用人和管理官員的權力。生活中，年羹堯手腕、手臂有病，妻子也有病，雍正多次詢問，並給他餵藥。雍正經常向年羹堯通報其父在北京的年齡、年貴妃和兒子福慧的身體狀況。
年羹堯權力膨脹，是因為雍正寵信太多，褒揚太多，咨詢太多。但年羹堯的囂張跋扈、忘乎所以、不守臣節，逐漸引起雍正的警惕和不滿，終於下定決心，要懲罰這個世上的“第壹負恩人”。
年羹堯的失寵和隨後的清洗，是由雍正第二次進京引發的。這次進京，他讓省長李、和省長範世傑跪下為他送行。到了北京，在郊區迎接我的是王侯以下的官員，年羹堯安然坐在馬背上經過，看也不看。王子們下馬迎接他，他只是點點頭。
年羹堯在北京期間，突然出任總理事務大臣。更有甚者，在雍正面前，態度十分傲慢，“沒人客氣。”年羹堯回任後，收到雍正的壹封朱昱:“凡人之臣，易成事，難成事；成功很容易，但保持工作很難；保持壹個人的工作是容易的，但最終很難實現它。.....若依功德，則背恩。”這位朱昱，壹反往日的溢美之詞，給年羹堯敲響了警鐘，從此他的處境壹落千丈。
雍正壹步步懲罰年羹堯。第壹步是年羹堯離京前後。第二步是向相關官員打招呼。雍正要麽叫他們警惕、疏遠、除掉年羹堯，要麽叫他們揭露年羹堯的劣跡，準備懲治年羹堯。第三步是把年羹堯從Xi安的老巢轉移出去。雍正先是罷免了年羹堯的親信、甘肅巡撫胡，並派四川提督回京，不能讓他有任何閃失。年羹堯被免去川陜總督之職，奉命交出傅園將軍的印信，調任杭州將軍。
年羹堯被轉移後，國內外官員更加了解情況，並揭露了他的罪行。雍正以居高臨下對待朝臣為名，剝奪了年羹堯的官職，並於當年9月下令將年羹堯逮捕，押解到北京聯合審理。12月，朝廷大臣將審判結果呈送雍正，為年羹堯列舉了92條大罪，並請求建立規範的刑罰。
雍正說這92項中有30多項是要處死和斬首的，但他在研究青海戰功年羹堯的時候特別仁慈，給他判了徒刑。年羹堯父兄中的官員全部被革職，嫡親子孫發兵流放，財產抄入官中。
形勢的變化深深地傷害了年羹堯的妹妹年貴妃的心。她對哥哥的不檢點感到不安，她害怕冰冷的世界。沮喪，害怕，後悔，各種不愉快的情緒把她壓垮了！她終於病倒了，雖然雍正帝早已下定決心要懲罰年羹堯，但年羹堯快死的時候不便動手，她也不忍心在年羹堯快死的時候雪上加霜。畢竟是他養尊處優了幾年的貴妃。
這年十壹月，年氏病危，雍正封土地為貴妃，並嘉許道:“臣溫良恭儉讓，在官內謹小慎微，在皇上身後小心翼翼；我即位後，貴妃致力於科舉考試和皇帝的重要大事，極力褒揚內政。”封賞並沒有挽救年氏的病，但是她病得很重，那個月就去世了。
年氏死後，稱敦肅為貴妃。乾隆初年，葬於泰陵。
年石死後僅壹個月，雍正帝就下手了。在這壹年過去之前，年羹堯被判了死刑。當年的大將軍，就這樣毀了，毀了。