糖皮質激素在應用生理劑量替代治療時無明顯不良反應，不良反應多發生在應用藥理劑量時，而且與療程、劑量、用藥種類、用法及給藥途徑等有密切關系。常見不良反應有以下幾類。
(1)靜脈迅速給予大劑量可能發生全身性的過敏反應，包括面部、鼻粘膜、眼瞼腫脹，蕁麻疹，氣短，胸悶，喘鳴。
(2)長程用藥可引起以下副作用：醫源性柯興綜合征面容和體態、體重增加、下肢浮腫、紫紋、易出血傾向、創口愈合不良、痤瘡、月經紊亂、肱或股骨頭缺血性壞死、骨質疏松或骨折(包括脊椎壓縮性骨折、長骨病理性骨折)、肌無力、肌萎縮、低血鉀綜合征、胃腸道刺激(惡心、嘔吐)、胰腺炎、消化性潰瘍或腸穿孔，兒童生長受到抑制、青光眼、白內障、良性顱內壓升高綜合征、糖耐量減退和糖尿病加重。
(3)患者可出現精神癥狀：欣快感、激動、不安、譫妄、定向力障礙，也可表現為抑制。精神癥狀尤易發生於患慢性消耗性疾病的人及以往有過精神不正常者。在用量達每日強的松
40mg或更多，用藥數日至二周即可出現。
(4)並發感染為糖皮質激素的主要不良反應。以真菌、結核菌、葡萄球菌、變形桿菌、綠膿桿菌和各種皰疹病毒感染為主。多發生在中程或長程療法時，但亦可在短期用大劑量後出現。
(5)下丘腦-垂體-腎上腺軸受到抑制，為激素治療的重要並發癥，其發生與制劑、劑量、療程等因素有關。每日用強的松 20mg以上，歷時
3周以上，以及出現醫源性柯興綜合征時，應考慮腎上腺功能已受到抑制。
(6)糖皮質激素停藥後綜合征可有以下各種不同的情況。①下丘腦-垂體-腎上腺功能減退，可表現為乏力、軟弱、食欲減退、惡心、嘔吐、血壓偏低、長程治療後此軸心功能的恢復壹般需要
9～12個月，功能恢復的先後依次為：i．下丘腦促腎上腺皮質激素釋放素(CRF)分泌恢復並增多；ii．ACTH分泌恢復並高於正常，此時腎上腺皮質激素的分泌仍偏低；iii．氫皮質素的基礎分泌恢復正常、垂體
ACTH的分泌由原來偏多而恢復正常；iV．下丘腦-垂體-腎上腺皮質軸對應激的反應恢復正常。②停藥後原來疾病已被控制的癥狀重新出現。為了避免腎上腺皮質功能減退的發生及原來疾病癥狀的復燃，在長程激素治療後應緩慢地逐漸減量，並由原來的壹日服用數次，改為每日上午服藥壹次，或隔日上午服藥壹次。③糖皮質激素停藥綜合征。有時患者在停藥後出現頭暈、昏厥傾向、腹痛或背痛、低熱、食欲減退、惡心、嘔吐、肌肉或關節疼痛、頭疼、乏力、軟弱，經仔細檢查如能排除腎上腺皮質功能減退和原來疾病的復燃，則可考慮為對糖皮質激素的依賴綜合征。
體重增加,多毛癥,痤瘡,血糖,血壓及眼壓升高,水鈉瀦留.可引起低血鉀,興奮,胃腸潰瘍甚至出血穿孔,骨質疏松,傷口愈合不良。 停藥應逐漸減量。
本品抑制抗原抗體反應，抑制白細胞移行和吞噬作用，減弱機體對外部感染的防禦功能。
本品除具有鹽皮質激素和糖皮質激素所***有的不良反應外，在用做抗過敏藥物中，下列的不良反應應予以註意。
心血管系統：本品對心血管的影響較少，但也有出現較危險狀況的報告；壹老年伴有冠脈供血不足的患者，服用本品引起心肌損傷，心電圖明顯改變，並導致急性心肌梗死。
中樞神經系統：本品可引起精神狀態的改變，加拿大報告了1例哮喘急性發作的患者。壹年多來，多次服用本品，不斷出現中度的欣快感和疲勞感，並出現短期精神抑郁、紊亂，病人不得已而停藥。3年後，此病人再次服用大劑量的潑尼松治療脈管炎，這種精神癥狀又重復出現。
內分泌、代謝：激素對垂體-腎上腺軸、生殖腺、甲狀腺和甲狀旁腺均有影響，對碳水化合物的代謝也有影響，通常會出現Cashing綜合征，人體對本品的個體差異較大，有的病人可耐受30mg，但有的僅能耐受7.5mg。
本品可引起繼發性的腎上腺功能障礙，壹研究報告，使用本品5mg，每日3次，1周後即出現了腎上腺功能不足，停藥後才得以恢復，如果連續用藥20周，可出現腎上腺明顯的萎縮，並持續數月，這種對腎上腺的抑制作用是時間、劑量依賴性的，如果使用劑量較大，甚至次日早晨就可出現ACTH分泌完全抑制，可的松類藥品可能誘發高血糖，服用本品40mg***4天，可使空腹血糖明顯增加。另壹研究報告，使用抗炎治療量的潑尼松可引起血液中的血糖基血色素(glocosylafed
hemoglobin)的增加，而且對正常人和初期的糖尿病人也有同樣的作用。
本品對礦物質代謝的影響很小，甚至在高劑量時也不引起水、鈉瀦留。
可的松類藥物對兒童的生長有抑制作用，對成年人則可誘發骨質疏松。為防止服用本品引起的骨質疏松，可***服鈣劑或鈣劑加維生素D類。
消化系統：本品可能引起急性胃腸炎。