公司擁有溫、養胃舒、益膽片、兒瀉停顆粒、銀菊清咽顆粒、化濁輕身顆粒以及正柴胡飲膠囊等獨家產品和國家中藥保護品種。
公司拳頭產品溫胃舒、養胃舒曾榮獲國家中醫藥管理局重大科技成果獎、中國中藥名牌、部優等稱號，為國家中藥保護品種、首批非處方藥、國家基本醫療保險藥品。獨家產品益膽片療效好、臨床必需、使用廣泛，產品質量穩定、價格合理、使用安全、方便，2000年進入《國家基本藥物目錄》。國家級新藥兒瀉停顆粒為純中藥制劑，安全無毒付作用，服用方便，用量小、純天然酸甜口味，口感好、見效快、療效高，在市場上受到廣大患者歡迎。 該產品配伍精良，經藥效學實驗及臨床驗證結果證實：溫胃舒、養胃舒具有益氣健脾，扶正固本，增強機體免疫功能的作用，並且具有抑菌、消炎、鎮痛、促進胃酸分泌的功能。對急、慢性胃炎，萎縮性胃炎療效顯著，總有效率達96.18%，安全無毒副作用。
溫胃舒、養胃舒對胃病治療的最大突破為“壹病兩藥，分型論治”，即“胃寒要用溫胃舒，胃熱要用養胃舒”。 “神鹿牌”六味地黃丸系運用現代制藥技術，精選地道藥材，濃縮藥物精華，精制而成。方中主要成分熊果酸、丹皮酚含量高於國家標準近2倍，在國家歷次質量抽查中居國內外同品種前列，產品市場抽查合格率100%。具有劑量小，療效好，便於服用，質量優，價格低等優點。是廣大患者理想的補腎精品。
華潤三九2011年第二次臨時股東大會審議通過了《關於購買本溪三藥、合肥神鹿、雙鶴高科、北京北貿四家公司100%股權的議案》，同意以人民幣4.0428億元的價格收購北京醫藥集團有限責任公司持有的遼寧華源本溪三藥有限公司、合肥神鹿雙鶴藥業有限責任公司、北京雙鶴高科天然藥物有限責任公司、北京北貿天然藥物經營有限責任公司四家公司100%股權。
公司已經支付全部轉讓價款4.0428億元。本溪三藥、合肥神鹿、雙鶴高科、北京北貿的股權轉讓過戶手續已於2011年12月26日或之前辦理完成。至此，本溪三藥、合肥神鹿、雙鶴高科、北京北貿四家公司100%股權轉讓交易已完成