1、觀察性研究
觀察性研究是指研究者不對被觀察者的暴露情況加以限制，通過現場調查分析的方法，進行流行病學研究。在概念上與實驗性研究相對立。觀察性研究主要包括橫斷面研究、病例對照研究和定群研究三種方法。
2、實驗性研究
實驗性研究是指在研究者控制下，對研究對象施加或消除某種因素或措施，以觀察此因素或措施對研究對象的影響。實驗性研究可劃分為臨床試驗、現場試驗和社區幹預試驗三種試驗方式。
3、數學模型研究
又稱理論流行病學研究，即通過數學模型的方法來模擬疾病流行的過程，以探討疾病流行的動力學，從而為疾病的預防和控制、衛生策略的制定服務。