細菌和真菌，如放線菌、腐生生物和原生動物。它們可以利用不同的碳水化合物，包括糖、澱粉、有機酸、纖維素、半纖維素等作為能量來源。最佳碳源是葡萄糖、麥芽糖、糊精、澱粉和甘油，其次是蔗糖、木糖、棉子糖、酒精和有機酸。有機酸中，乙酸、乳酸、檸檬酸、琥珀酸和蘋果酸較易使用，草酸、酒石酸和馬尿酸較難使用。壹些放線菌還可以利用幾丁質、碳氫化合物、單寧甚至橡膠。
異養生物:小型無脊椎動物，如蜣螂和蚯蚓。它們粉碎植物殘體，在微生物的作用下，起到加速有機物分解轉化的作用。此外，這些土壤動物還可以在體內分解，將有機物轉化為無機鹽，供植物再次吸收利用。還有中大型的食腐動物，比如禿鷲。