六味地黃丸以“三補三瀉”為特色，“三補”包括熟地黃、山藥、山茱萸，均有滋陰填精的功效。防止滋補過度，與牡丹皮、茯苓、澤瀉配伍，有清虛火、祛邪利濕之功。
因此，六味地黃丸可廣泛用於治療腰膝酸軟、腎陰虛潮熱、頭暈、盜汗、遺精、耳鳴耳聾、手足心熱、舌紅少苔等癥。
很多亞健康狀態，免疫力低下，更年期綜合癥，腰酸腿軟都可以用六味地黃丸來治療，很多人也早就把這種藥當成保健品來用了。但六味地黃丸性寒油膩，部分腎陽虛、脾胃虛弱、陽虛、痰濕壅盛者不宜長期服用。
六味地黃丸加知母、黃柏可加強滋陰降火清熱功效，更適用於骨蒸潮熱。
加入麥冬和五味子，被稱為麥味地黃丸，具有滋補心肺腎的作用，更適用於口幹、心煩、失眠。
此外，枸杞、菊花成為杞菊地黃丸，強化了滋補肝腎的功能，更適合視物模糊、面紅、目眩的人；
此外，當歸、白芍被稱為歸芍地黃丸，能強化補血養血的功能，比較適合肝腎陰虛、血虛的人；桂附地黃丸，以六味地黃丸為基礎，更適合腎陽虛、腎陽虛的人服用。
以上的加減法都是常用的公式。加味後，增加了六味地黃丸的適用範圍。