1、根據樣品的重量（1g樣品加入3.5ml提取液，可根據材料不同適當添加），配制提取液於冰上。
2、將樣品放入研缽中，用液氮研磨，研磨後加入提取液中，冰浴（3-4 小時）。
3、離心8000rpm40min4℃或11100rpm20min4℃
4、提取上清液，樣品制備完成。
蛋白提取液：300ml
1、1Mtris-HCl（PH8）45ml
2、甘油（Glycerol）75ml
3、聚乙烯基聚吡咯烷酮（Polyvinylpolypyrrordone）6g
本方法針對SDS-PAGE、垂直平板電泳！
二、植物組織蛋白提取法
氯乙酸-丙酮沈澱法
1、將葉片在液氮中研磨
2、加入3倍體積的樣品提取液於-20℃過夜，然後離心（4℃8000轉/分以上1小時）棄上清液。
3、加入等體積的冰浴丙酮（含 0.07% 的 β-巰基乙醇），搖勻，然後離心（4℃ 8000rpm 以上 1 小時），再真空幹燥沈澱，備用。
4、取樣前加入裂解液，室溫放置 30 分鐘，使蛋白質充分溶於裂解液中，然後離心（15℃ 8000rpm 以上 1 小時或更長時間，以無沈澱為標準），4℃下可暫時保存待用。
5.用 Brandford 法對蛋白質進行定量，然後分裝到 -80℃ 中備用。
藥物：提取液：含 10%三氯乙酸和 0.07%β-巰基乙醇的丙酮。裂解液：2.7g 尿素 0.2g CHAPS 溶於 3ml 滅菌去離子水中（最終體積為 5ml），使用前加入 1M DTT 65ul/ml 即可。
本方法適用於雙向電泳，其特點是雜質少、離子濃度小！當然，單向電泳也同樣適用，只是電泳條帶會少壹些！
組織：腸粘膜
目的：WESTERN BLOT檢測細胞雕亡相關蛋白的表達
應用TRIPURE提取蛋白質的步驟：
含蛋白的上清液中加入異丙醇：（每1 ml用量中加入1.5 ml TRIPURE）
倒置混勻，室溫放置。10 分鐘
離心：12000 g，10 分鐘，4 度，棄上清液
加入 0.3M 鹽酸胍/95%乙醇：（每 1 毫升 TRIPURE 加入 2 毫升）
搖勻，室溫放置 20 分鐘
離心：7500 g，5 分鐘，4 度，棄上清液
重復 0.3M 鹽酸胍/95%乙醇步驟 2 次
沈澱中加入 100% 乙醇 2 毫升
充分搖勻，室溫放置 20 分鐘
離心：7500g，5 分鐘，4 度，棄上清液，吹幹沈澱
1% SDS 溶解沈澱
離心：10000g，10 分鐘，4 度。
取上清液，-20℃保存（也可直接用於 WESTERN BLOT）
問題：加入 1%SDS，沈澱不溶解，還是很大壹塊，4℃離心後，白色沈澱更多，SDS 結晶呢？測濃度，含量只有 1mg/ml 左右。
解決方法：提蛋白試劑盒，除組織大小合適外，待打碎後，立即加入2X BUFFER，再煮沸5-10分鐘，效果很好。蛋白質樣品的制備
按照 Davermal 等人（1986 年）的方法提取幼苗蛋白質樣品。
剪取 100 毫克材料，加入 10 毫克 PVP-40（聚乙烯吡咯烷酮）和少量石英砂（用液氮研磨成粉末）、1.5 毫升 10%三氯乙酸（丙酮制劑，含 10 毫摩爾，即：0.07%β-mer）和 1.5 毫升 0.07%β-mer-乙酸（丙酮制劑，含 10 毫摩爾，即：0.07%β-mer）、加入 1.5 毫升 10%三氯乙酸（丙酮制劑，含 10 毫摩爾，即 0.07%β-巰基乙醇），攪拌，沈澱物在 -20°C 下沈澱 1 小時，4°C、15,000 轉/分離心 15 分鐘，棄上清液。將沈澱重新溶解於 1.5 ml 冷丙酮（含 10 mM β-巰基乙醇）中，然後在-20℃下沈澱 1 小時，同上離心，棄上清液，（必須使用低溫冷凍和真空幹燥得到的 80%丙酮（含 10 mM β-巰基乙醇）沈澱）。
每毫克幹粉加入 20 微升（可調）UKS 溶液[9.5 M 尿素、5 mM 碳酸鉀、1.25% SDS、0.5% DTT（二硫蘇糖醇）、2% Ampholine（Amersham Pharmacia Biotech Inc，pH 3.5-10）、6% Triton X-100]。溶液應在 37℃下孵育 30 分鐘，孵育期間多次攪拌，然後在 28℃（溫度低，尿素濃度高會使溶液結冰）下以 16000 r/min 離心 15 分鐘，離心力越大，時間越長越好！上清液可取樣電泳。或-70度保存
六、植物根中蛋白質的提取
（1）樣品，液氮研磨
（2）用離心機裝入1.5ml離心管
（3）加入1M KH2PO4 K2HPO4 700 ul
（4）12000轉/分，4度，10-15minite
（5）取上層液，蛋白質就在裏面
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