1、抗菌抑菌
藿香正氣水是壹味中藥，含有藿香、紫蘇、白芷、桔梗等抗菌藥物，夏天用藿香正氣水擦拭患處、對夏季預防外傷感染很有效，對頭癬、足癬、灰指甲等細菌感染性疾病也有較好的治療效果。
2、祛濕邪
疔瘡在中醫上認為是內生濕熱、血熱，或外感濕熱、暑邪，尤其在夏季容易發生，稱為夏疔；在現代醫學中，癤腫是葡萄球菌感染引起的，藿香正氣水有殺菌消毒的作用，也有祛濕熱的功效，用棉簽蘸藿香正氣水外擦，可有效預防外傷感染。用藿香正氣水外擦，可有效治療各種癤腫。
3、治療外陰瘙癢
由於藿香正氣水是由多種致病菌和殺滅滴蟲的藿香、紫蘇、白芷、生姜等藥物組成，所以治療外陰瘙癢有較好的療效。只要將藿香正氣水兌水稀釋，定期清洗女性私處外部，就能有效止癢，還有清涼的感覺。
4、治療身體不適
夏季也是旅遊的高峰期，很多人都會出現身體不適的現象，而藿香正氣水具有解表祛濕的作用，對中氣不足以及消化不良、嘔吐、腹瀉等不適病癥有很好的療效，在出現癥狀時飲用10毫升即可。
5、預防暈車暈船
暈車暈船是最難纏的小麻煩，藿香正氣水具有刺激神經的功效，因此，在乘車乘船前，將少量藿香正氣水塗抹在耳後、肚臍、太陽穴等處，可以有效預防暈車暈船。
6、治療白癜風
中醫認為，白癜風是風濕侵襲毛孔，使氣血癌滯，毛竅閉塞而成。而藿香正氣水具有芳香行氣的作用。氣以血帥，氣行則血行，血行則瘀散。
7、治療外痔
藿香正氣水中含有多種中藥成分，不僅具有清熱降火的功效，而且還有殺菌抑菌的作用，用溫開水加少量藿香正氣水，沖洗肛門，對外痔有很好的治療效果。
八、調理腸胃
厚樸正氣水以藿香為主藥，含有揮發油，能促進胃液分泌，增強食欲和消化功能，並對胃腸有解痙、殺菌作用，故有芳香健胃之功效。
厚樸香正氣中還含有紫蘇、生姜、陳皮，能增加消化液的分泌，抑制腸道異常發酵，促進瘀滯之氣的排出，故能加強主藥藿香的健胃力量。
9、祛痰止咳
桔梗含皂苷，陳皮含揮發油，均有刺激祛痰作用；半夏的鎮咳作用明顯；甘草既能祛痰，又能鎮咳；陳皮對氣管、支氣管有輕度擴張作用，能幫助平喘。諸藥合用，共奏祛痰、止咳、平喘之效。
10、藿香正氣水的禁忌
（1）服用後不要立即開車
服用藿香正氣水後，乙醇沒有揮發，如經交警檢測，會被檢出乙醇超標，誤認為酒後駕車。因此，服藥後應至少半小時後再開車，並多張嘴，使乙醇盡快揮發。
（2）乙醇過敏者慎服藿香正氣水
對乙醇過敏者服用藿香正氣水會出現過敏反應，表現為全身發熱、心跳加快、皮膚潮紅、丘疹、瘙癢、煩躁不安、血壓下降等癥狀。
（3）使用萬古黴素時慎用藿香正氣水
萬古黴素與乙醇會產生二硫化醒樣反應，出現面部發熱、潮紅、頭痛、出汗、血壓下降、煩躁不安、視物模糊等癥狀，嚴重者還會出現休克、抽搐等。