要實現醫學信息的標準化其中最為困難的是軟件產品的標準化。
醫學信息標準是指在醫學信息中廣泛應用到的標準 及醫療應用方面的標準，對於應用於醫療方面的專業技術標準。
在醫學信息中廣泛應用到的標準 及醫療應用方面的標準，對於應用於醫療方面的專業技術標準，如：用於通訊的通訊協議標準UDP、TCP/IP 、FTP等等，以及用於存儲的JPEG 、TIFF 、PICF 、FAX 、Media等方面的標準，在涉及的時候，會給出相應的簡單說明，但並不列出在下表中，因為此類標準並不需要醫院的IT人員了解也會廣泛應用在各個方面。
其醫療方面的應用標準，如果醫院的人員和醫學信息學的研究人員不了解的話，是無法獲得更好的應用和發展的，也無法借鑒其中成功的或者是失敗的標準化經驗。
國外標準：
ATC（Anatomical Therapeutic Chemical） 解剖-治療-化學代碼；是壹種藥物系統分級分類法。在19世紀70年代初，挪威醫學供應部擴展了已有的歐洲制藥市場研究協會解剖和治療3級分類系統，並增加了2個化學級。後來，ATC分類獲得WHO藥物應用研究組認可，並由在奧斯陸的WHO藥物統計方法合作中心(WHO Collaborating Centre for Drug Statistics Methodology)負責維護。?
ATC的優點如下：?
（1）確定了壹個藥物產品，包括有效物質、用藥途徑和相關的劑量。?
（2）既面向治療、又面向化學藥品，這個特征是其他系統所缺乏的。
（3）其分級結構允許邏輯分組。?
（4）已作為WHO藥物應用研究的國際標準。?
缺點是：
沒有包含復合產品、皮膚病制劑和局部用的復方制劑。 CPT（Current Procedural Terminology,美國） 通用過程術語學；是美國的付賬賠償編碼體系中使用的壹套編碼系統，基於消費來定義診斷和治療過程，提供了編碼策略。
是醫院所使用的臨床操作與提供服務的分類編碼與術語體系，在美國的付款和應用評估方面廣為使用。每年由美國醫學會(American Medical Association，AMA)發布壹次。（在論壇的壹些國外DEMO上，常可見到CPT4，指的是CPT的第四版本：Current Procedural Terminology,4th Edition）