近年來，日本醫學家和生理學家研究發現，大豆的蛋白質是不溶的，但制成納豆後，就變成可溶的，並產生氨基酸，而原料中不存在的各種酶會被納豆菌和相關細菌產生，有助於胃中的消化和吸收。納豆的成分為:水分61.8%，粗蛋白19.26%，粗脂肪8.17%，碳水化合物6.09%，粗纖維2.2%，灰分1.86%。作為植物性食物，粗蛋白和脂肪是最豐富的。納豆是壹種高蛋白的營養食品。納豆中含有的植物甾醇可以消除多余的膽固醇，分解脂肪酸，使異常的血壓恢復正常。
納豆激酶能直接分解血栓，每克濕納豆的溶栓作用相當於尿激酶1600IU。納豆激酶對血栓的作用時間長達8-12小時，而尿激酶只有30分鐘。尿激酶只能註射，納豆激酶可以註射也可以口服，在毛細血管中發揮作用。納豆在日本已經食用了1000年，是壹種安全的食用血栓預防劑。
調節血脂，動物實驗證明，納豆食品可以抑制血液中LDL氧化，有效降低總膽固醇和甘油三酯的濃度，進而減少動脈粥樣硬化的發生。
調節血糖，納豆芽孢桿菌可在腸道內持續存在約1周，可促進其他有益菌的增殖。腸道細菌，重約1 kg。當然，它需要誘餌。人體吸收的營養成為腸道細菌的誘餌，被吞噬。另外，納豆激酶可以燃燒脂肪，所以可以減肥。還有納豆粘稠物質，起到浸出和包裹的作用。所以納豆減肥緩慢有效，不會反彈。但很直觀的是，餐後血糖值呈明顯下降趨勢。壹種是納豆菌吞噬葡萄糖和粘液，另壹種是納豆中的彈性蛋白酶(或胰蛋白酶E)抑制血糖升高。它與豬胰腺中所含的這種酶具有作用，並且來自豬胰腺的彈性蛋白酶已被用作高血糖癥的治療藥物。
減緩減肥的速度。納豆中的粘蛋白由谷氨酸多肽組成，具有特殊的結構，不能被人體腸道吸收。它的吸水率比膳食纖維高，和膳食纖維壹起膨脹，減少身體對脂肪的吸收。此外，納豆中的維生素K2支持體內脂肪燃燒，防止脂肪在體內堆積，實現健康減肥新概念。納豆是充分利用黏蛋白“拒絕脂肪”的特性和維生素K2“燃燒脂肪”的功效精制而成，加上祛瘀瘦身的因子，減肥效果很好，真正的健康綠色。
預防骨質疏松，納豆輔助補鈣的機理是:骨骼由維生素K2和優質蛋白質組成，先形成骨蛋白，再與鈣形成骨，積聚骨骼，增加骨密度。納豆含有大豆異黃酮和維生素K2。大豆異黃酮可以阻止骨骼中鈣的溶解，而維生素K2可以固定骨骼中的鈣。換句話說，大豆異黃酮和維生素K2的組合可以共同增強骨骼。
大豆異黃酮是改善女性更年期的主要植物雌激素之壹，具有弱雌激素樣作用。納豆中30毫克異黃酮相當於大豆中100毫克異黃酮。女性的更年期癥狀和絕經後骨質疏松癥主要是由於體內雌激素水平下降引起的。大豆黃酮能補充體內雌激素不足，不僅能明顯改善更年期癥狀，還能防治女性骨質疏松。考慮到納豆的解毒、美容、減肥作用，納豆對於女性來說是非常重要的保健食品。