食品安全和應用營養中心是食品藥品監督管理局負責規範美國境內幾乎所有食品的安全和標簽使用的分支機構。不在其監管範圍內的包括來自已馴化動物的肉類制品，如牛肉和雞肉，該類產品由美國農業部食品安全監督服務局負責監管。而含有微量肉類的產品則歸於美國食品藥品監督管理局監管。兩者之間的精確界限則列於這兩個部門之間簽署的諒解備忘錄中。另外，用於家畜的藥品和其他產品則歸於美國食品藥品監督管理局的另壹分支機構——獸藥中心管理。其他不歸美國食品藥品監督管理局監管的消費品包括酒精量高於7%的飲料（由美國聯邦司法部煙酒槍械炸藥局負責監管）和非瓶裝飲用水（由美國國家環境保護局負責監管）。
食品安全和應用營養中心也負責建立和修改食品標準，例如身份標準（如壹種產品被貼上“酸奶酪”的標簽需要什麽條件）等，以及設置多數食品的營養標示要求。這兩部分的標準都被收錄到《美國聯邦法規》（Code of Federal Regulations）之中。1994年通過的《膳食補充劑健康教育法》(Dietary Supplement Health and Education Act)指定由美國食品藥品監督管理局負責膳食補充劑的監管工作。然而，法律並沒有規定膳食補充劑須進行安全性和有效性測試，迄今也沒有任何法定標準，所以美國食品藥品監督管理局只能在該膳食補充劑被證明不安全時才能采取行動。膳食補充劑的制造廠商被允許在這些產品的標簽中作出關於健康權益的“結構或功能聲明。他們也許不會聲明該產品可以醫治、診斷、治愈或預防某種疾病，但是在標簽中必須包含某種免責聲明。
美國市場上的瓶裝水由美國食品藥品監督管理局和各州政府聯合實施監管，自來水則納入州法規和地方法規的管轄範疇，並由聯邦環保署實施監管。美國食品藥品監督管理局對於瓶裝水的監管須遵循聯邦環保署設立的指導方針，同時新設立的環保署法規也自動適用於對瓶裝水的監管，除非美國食品藥品監督管理局對此進行了更加詳細的重新規定。盡管美國瓶裝水產業的質量控制並沒有城市供水嚴格，但是美國市場的瓶裝水灌裝瓶仍被要求實施類似其他食品的檢查。 藥品審評和研究中心對於三大類的藥品制定了不同的標準，這三大類藥品為：新藥、非專利藥和非處方藥。壹種藥品如果是由壹個不同的制造商使用不同的輔藥（excipients）或非活性成分（inactive ingredients）制作而成，被用於不同的治療目的，或者藥品已有其他任何實質性的變化即可稱為“新藥”。對於新藥最嚴格的要求是在“新分子實體”（new molecular entities）層面上不得雷同於任何已經存在的藥物。
新藥
新藥在被美國食品藥品監督管理局批準之前需要進行大量的研究觀察，這個程序被稱為“新藥申請審評程序”（NDA）。在默認情況下，新藥只有憑醫囑才能買到。新藥成為非處方藥（OTC）首先需要經過新藥申請審評程序並被批準，之後還要有壹個獨立的審查程序。
新藥被批準就意味著“當直接使用時是安全而有效的”。
廣告和促銷
美國食品藥品監督管理局負責審查和管理處方藥的廣告和促銷活動。（包括非處方藥廣告在內的其他類型的廣告則由聯邦貿易委員會管理）在藥品廣告監管中有兩個關鍵性的要求。壹是在大多數情況下，藥品制造商只能在廣告中宣傳該種藥品已被批準的特定特性或醫療用途。而藥物許可適應癥以外之使用方式（off-label use），即基於被批準的使用目的之外的目的使用藥品，在醫療實踐中十分常見。同時廣告需要註意在宣傳藥品優點和提醒用戶藥品可能存在的風險之間把握平衡。
藥品上市後的安全性觀察
在經歷新藥申請審評程序並被批準後，藥品制造商必須審查並向美國食品藥品監督管理局報告它所掌握的每壹起藥物不良反應事件。十分嚴重和致命的藥物不良反應事件必須在15日內上報；其他事件則按季度上報。美國食品藥品監督管理局亦可直接通過它的安全信息及不良反應通報程序（MedWatch program）獲得藥物不良反應報告，由於這些報告是由用戶或醫療專業人士主動上報，所以被稱為“自發性報告”。盡管這已經成為藥品上市後安全性觀察的最主要手段，但是美國食品藥品監督管理局對於藥品上市後風險管理的必要性仍然與日俱增。在藥品被批準的情況下，制造商被要求進行更多的額外臨床實驗，這被稱為新藥臨床試驗IV期。在某些情況下，美國食品藥品監督管理局所要求的藥品風險管理可能包括其他種類的研究、約束或安全性觀察措施。
非專利藥
非專利藥是專利權保護已經過期的處方藥，因此允許其他制造商制造和銷售。對於非專利藥的批準，美國食品藥品監督管理局需要科學的證據證明該藥品與最初被批準的藥品之間是可替換的或在治療的意義上是等同的。
非處方藥
非處方藥是不需醫生處方就可獲取的藥品和復合劑。美國食品藥品監督管理局列出了壹個表單，其中的近800種成分通過多種方式的組合產生了10萬多種的非處方藥。另外，許多非處方藥的組成成分也屬於處方藥範疇，但是被認為無需醫療人員的監督亦可安全使用。疫苗、血液與人體細胞組織產品、生物制劑監管 生物制品審評和研究中心是美國食品藥品監督管理局負責生物學治療安全性與有效性的分支機構，負責監管的產品包括血液和血液制劑、疫苗、過敏原、人體細胞組織產品和基因治療產品。新的生物學醫療產品在上市前需要經歷壹個類似於藥品的申請審評程序。政府對於生物學醫療產品進行監管的原始授權來源於1902年的《生物制品管制法》（Biologics Control Act），附加授權來源於1944年的《公***保健服務法》(Public Health Service Act)。另外，《聯邦食品、藥品和化妝品法案》(Federal Food,Drug,and Cosmetic Act)也適用於生物學醫療產品的監管。原來承擔生物學醫療產品監管責任的機構隸屬於美國國立衛生研究院，在1972年這項授權被轉移至美國食品藥品監督管理局。 設備儀器與放射健康中心是美國食品藥品監督管理局負責對所有醫療設備進行上市前的審批工作以及監管這些設備的制造、工作性能和安全性的分支機構。在《聯邦食品、藥品和化妝品法案》(Federal Food,Drug,and Cosmetic Act)對“醫療設備”進行了定義，它包括從簡單如牙刷到復雜如可植入腦起搏器的諸多器械。設備儀器與放射健康中心還負責對具有輻射性的非醫療器械的安全性能進行監管，這些設備包括手機、機場行李檢測設備、電視接收器、微波爐、紫外線保健房和激光產品。
設備儀器與放射健康中心的管理權責包括要求設備制造商或進口商提交關於設備的技術報告，要求放射性設備符合安全性能指標，公布有瑕疵產品，要求召回有瑕疵或無效產品。設備儀器與放射健康中心也直接進行部分產品的檢測工作。 獸藥中心是美國食品藥品監督管理局負責對提供給包括食用動物和寵物在內的動物的食品、食品添加劑和藥品進行監管的分支機構。獸藥中心不負責監管動物疫苗，該類產品由美國農業部管理。
獸藥中心最基本的工作是監管提供給食用動物的藥品，確保其不至於影響對人類的食物供應。美國食品藥品監督管理局控制瘋牛病的工作也是通過獸藥中心對飼料制造商的檢查得以施行。 2007年12月19日，美國食品藥品監督管理局宣布建立壹個用以跟蹤食物系統中的克隆動物的數據庫，借以使相關鑒別程序得以有效進行。這個數據庫將成為全國動物識別系統(National Animal Identification System)的壹部分，該系統用於跟蹤全美所有從還在農場飼養到已上餐桌的家畜。