②住院報銷待遇不同。
③普通門診待遇不同。
④參保條件不同。
⑤參保標準不同。
⑥個人賬戶不同。
⑦就醫原則不同
1．繳費標準不同。
壹檔：是按職工月工資總額的8.2%或7.2%繳費，其中個人只需繳納2%，單位繳納6.2%或5.2%；
二檔：是以深圳市上年度在崗職工月平均工資為基數，比照0.8%，其中單位繳納0.6%，個人繳納0.2%；
三檔：也是以深圳市上年度在崗職工月平均工資為基數，繳費比照0.8%。以深圳市上年度在崗職工月平均工資為基數，繳費比照為0.55%，其中單位繳納0.45%，個人繳納0.1%。
2、住院報銷待遇。
壹等、二等參保人員：在定點醫院發生的醫療費用可按95%或90%報銷。三級參保人員在不同醫院的報銷比例不同，壹級醫院報銷85%，二級醫院報銷80%，三級醫院報銷75%；
3、普通門診待遇不同。
參保人員參加壹檔，是醫保個人賬戶，其賬戶余額可用於支付醫療費用，在杜康中心發生的費用70%由個人賬戶支付，30%由統籌基金支付。
參加二、三級醫療保險的，不實行個人繳費。如果是甲類藥和乙類藥，門診統籌可以報銷80%和60%。單次診療或醫保目錄內醫用材料的，報銷比例為 90%，最高報銷金額不超過 120 元。門診醫療費用年度支付限額為1000元。
4、參保條件不同
在深圳，醫保按繳費和相應待遇分為壹、二、三檔，每種形式的醫保對應不同的參保人群：
如果是深戶員工，單位應為其參加醫保的第壹檔；
如果是非深戶，可以選擇壹、二、三檔中的壹種參加。
5、參保標準不同
參加壹類醫保，職工月工資總額最高為深圳市上年度在崗職工平均工資的3倍（目前為34860元），最低為深圳市上年度在崗職工平均工資的60%（目前為6972元），按月繳費，其中用人單位繳納6.65%，個人繳納2%。
參加第二檔醫療保險，按深圳市上年度在崗職工月平均工資11620元的0.8%（基本醫療保險+地方補充醫療保險）的標準按月繳費，其中用人單位繳納1.05%，個人繳納0.2%。
第三檔醫療保險，按深圳市上年度在崗職工月平均工資11620元的0.55%（基本醫療保險+地方補充醫療保險）的標準按月繳費，其中用人單位繳納0.9%，個人繳納0.1%。
6、個人賬戶不同
醫保壹檔參保後，建立個人賬戶，賬戶裏繳納的錢可以在門診使用。醫保二、三檔不建立個人賬戶，采取門診統籌的方式進行門診統籌。
①壹類參保人員：
個人賬戶累計儲存額超過本市上年度在崗職工平均工資5%（即139436元×5%=6971.8元），超出部分可在定點藥店購買醫保目錄範圍內的非處方藥；
可用於本人及已參加本市基本醫療保險的配偶、直系親屬的醫療保險支付。在定點醫療機構就醫的基本醫療和地方補充醫療自付費用；參加本市基本醫療保險的本人、配偶及直系親屬的體檢和預防接種費用。
同時，壹類參保人員連續參保滿壹年的，在同壹醫保年度內，門診基本醫療費用和地方補充醫療費用自付比例超過當時在崗職工平均工資5%的，超出部分由統籌基金按規定支付70%（70周歲以上支付80%）。
②二類參保人/三類參保人：不行，去藥店買藥不能刷社保卡。
7、就醫原則不同
壹等參保人：全市任何壹家定點醫療機構。
二類參保人：在綁定的社區衛生服務中心門診就醫，在本市任壹定點醫療機構住院治療，在規定的醫療機構門診大病治療。
三級參保人員：在綁定的社區衛生服務中心門診治療，在規定的醫療機構住院治療和重大疾病門診治療。
法律依據：
《中華人民共和國社會保險法》第二十三條***和國家規定的職工應當參加職工基本醫療保險，由用人單位和職工按照國家規定***共同繳納基本醫療保險費。
無雇工的個體工商戶、未參加用人單位職工基本醫療保險的非全日制從業人員以及其他靈活就業人員，可以參加職工基本醫療保險，由個人按照國家規定繳納基本醫療保險費。