以醫院各類會計報表為基礎，運用壹定的方法對有關會計信息進行整理、比較和評價，為醫院的管理決策提供有用信息的分析方法。壹般采用指標比較法和因素分析法。
計劃完成情況分析法分析醫院醫療服務和經營任務的完成情況，明確完成或未完成任務的主要原因及改進措施，為制定下期計劃提供客觀依據。主要以基本數字表格和相關文字為分析依據。主要分析方法是將計劃實施的實際效果與計劃進行比較。如出院人數、門急診人次等指標與上年同期進行對比分析。
收支分析對醫院醫療服務和經營活動中的收支情況進行分析，明確各項業務收支預算的執行情況，為下期收支計劃的制定提供依據。主要以損益表、藥品收支表及相關指標表的基本數字作為分析依據。如醫療收入、醫療支出、職工人均業務收入等指標與上年同期進行對比分析。
財務狀況分析是以會計住所資料為依據，綜合醫院計劃、統計資料和業務核算資料，對壹定時期內醫院財務活動過程進行比較、分析和研究，並作出正確評價的壹種方法。通過財務分析可以總結醫院醫療服務經營管理中的經驗教訓，不斷完善財務管理，提高醫院經濟管理水平。財務分析的主要依據是資產負債表、損益表、藥品收支表、資金增減表。其內容主要包括醫院業務發展分析、財務狀況分析、醫院收支平衡分析、勞動生產率分析、醫院效益分析、財產物資利用分析等。主要包括職工人均業務收入、百元固定資產、醫療收入、單位閑置面積占用固定資產、單位門診收費水平、出院病人平均醫療費用、藥品收入占醫療收入比重、流動比率、速動比率、資產負債率、固定資產凈值、存貨周轉率、藥品周轉率等指標。
醫院會計報表分析的內容和方法，還可以根據醫院管理的實際需要，運用多種經濟分析方法，開展各種專題、專項或綜合性較強的分析研究。