華藥集團公司有很強的自主研發能力。1970年原廠中心試驗室經擴大充實，改組為抗生素研究所，致力於新抗生素的開發，並先後在國內率先開發成功桿菌肽、春雷黴素、平陽黴素、兩性黴素B、林可黴素、克林黴素、克林黴素磷酸酯、去甲基萬古黴素等十余種產品。1991年，抗生素研究所改組為新藥研究開發中心，成為醫藥行業第壹家國家認定企業技術中心。新藥中心集中了兩百多名優秀的研發人員，裝備了先進的實驗儀器，並具有完整的中試系統，使新藥開發和成果轉化成為壹項系統工程。由於長期高強度的投入，每年都有新產品投放市場。在自主研發的同時，華藥與眾多的國內外科研機構開展密切合作，吸引各種科技資源到企業中來，開展產學研聯合創新。
華藥的新藥開發正由仿向創轉移。自八十年代中期以來，逐步引進和學習先進的開發創新藥物的平臺技術，通過與科研機構合作，逐步形成了自己的創新藥物開發體系，重點圍繞天然藥物與小分子藥物篩選、組合化學技術、現代生物技術開展創新藥物研究。
1997年華藥被國家經貿委認定為技術創新試點企業，在研發上得到有力支持，2000年華藥被科技部認定為863高科技研究發展計劃成果產業化基地。
科技進步是華北制藥集團發展的動力。
華北制藥集團技術開發部、新藥開發中心、環境保護技術研究所、規劃設計院和工程部***同從事產品開發及其產業化工作。
華北制藥集團有壹支較高水平的科研隊伍，擁有先進的科研開發裝備，具備較強的新產品開發和中試能力。
截止到1999年止，華北制藥集團***獲得國家發明獎5項。國家科技進步獎18項，省（部）級科技進步獎70項。
八五期間，華北制藥集團投產新產品、新品種達30余種，1999年度新產品、新品種、新規格產品產值達9億元。
華北制藥集團公司是國家經貿委第壹批技術創新試點企業，華北制藥集團新藥開發中心是我國第壹批國家級認定的企業技術中心。中心承擔的13個新產品研究和2項重大工藝研究課題，已完成2個新產品研究，獲新藥批準文號4個，已有6個新藥進入中試階段。
至2000年後，每年將有1-2個創新藥物或現代生物技術藥品投放市場。