水草除了對光、水及CO2基本的需求外，還要從生長的環境中吸取養分，才能維持正常的生長。這些養分就包括了多種微量元素，之所以稱之為微量，除了這些元素在自然界中含量極少之外，還因為水草對這些的元素需求量很少，雖然需求量很少，但卻是要用到的。也是常用肥料中的成分。
在封閉的水草缸中，這些元素的含量很少，所以另外添加，以維護滿足水草的需求，如果不及時添加這些肥料，那麽水中的元素很快就會被水草吸收殆盡，水草就會因為缺乏養份來源而不能正常生長，甚至產生營養性的疾病，嚴重時會枯萎，會死亡。 因為水草在水下生活，所以水草只能吸收水中的養份，所以水草所用到的肥料符合這壹特性，才能達到施肥的目的。所以肥料在水中有溶解的特性，這樣肥料才會有用處。
水草在生長過程中，和陸地上的植物壹樣，不僅需要光、適宜的溫度和二氧化碳等，同時，也需要施肥。水草肥料按功能可分為：底肥、根肥、液肥、鐵肥、微量元素；按水草需求不同分為：磷肥、氮肥、鉀肥、微量元素；還可以按照肥料的形態不同分為固體肥、液肥。
按照功能介紹水草肥料，可分為五種。
1、底肥
壹般底床以沙礫或水草泥為主，而它們所含得營養物質較少，特別是氮、磷，鉀等肥料。所以在種植水草前，需要在底床中施加底肥，以利於水草的生長。不過，施入底床的底肥要經過硝化細菌進行分解，才能完全被水草吸收。
2、根肥
根肥顧名思義靠近水草根部施加，主要作用於植物根部。質地優良的根肥擁有較強的肥性與較好的緩釋性,可以長期有效的釋放植物所需要的鐵元素與微量元素，促進水草生根，還可改善植物狀態!
壹些水草玩家喜歡給紅色水草添加鐵根肥，那是因為鐵根肥對紅草的育成的好處。不過需要光照、CO2及水質合適，那麽紅色水草的狀態會很好！
4、液肥
液肥是將多種營養元素混合壹起研制而成的肥料，對水草的生長發育具有良好的效果。施肥時，水箱內要換掉1/3的水，再放入肥料。
通常情況下，植物所需要的肥料是由氮、磷、鉀三要素組成，而氮、磷和外及鐵等元素都存在於土壤中，只有當土壤中缺乏某種營養時，才進行施肥加以補充，水草獲取營養的方式卻不壹樣。由於環境的局限，它只有從水中吸收，而底床上不施加肥料，這時候在水中添中液肥合適的。
3、鐵肥
鐵在植株中的含量以葉片中高。 鐵不是葉綠素的成分，但是它在葉綠素的形成中是不可缺少的。水草缺鐵時因葉綠素的形成受到障礙而發生“失綠癥”。因此，鐵含量的多少影響作物體的呼吸作用、光合作用和硝酸還原等。
水草缺鐵時，固氮能力減弱，生長狀態會出現不良現象。所以水草含鐵的適宜範圍為 50 — 250 毫克 / 千克，低於 50 毫克 / 千克就可能出現缺鐵癥。而紅色水草的發色也是依賴於鐵元素的含量，所以水草玩家需要不定時的為水草添加鐵肥。
4、微量元素
水草在生長過程中，不僅需要氮、磷、鉀三要素，同時也需要鎂、鐵、硫、錳等多種微量元素。如果水草缺乏這些微量元素，也會導致水草生長不良。
鎂、鐵是植物細胞內形成葉綠素的重要金屬有機化合物成分。當鎂不足時，常使葉片的葉脈變深，而葉片發黃，壹般水草所需要的鎂，其含量非常小。當鐵素含量不足時，葉片呈淡黃色，嚴重時變成白色，癥狀先從幼嫩葉上發生，後漸危及老葉。
錳可以促進水草的初期生長。缺錳時，使水草葉面呈現枯萎黃化現象，但葉脈 仍為綠色。只有在嚴重缺錳的情況下，葉片上才會出現褐斑。看來錳的缺乏與鐵的含量過多相關。
除以上元素之外，還有硫、鈣、鋅、銅、硼、氯等多種微量元素。它們對水草的生長發育也都是所需的。如果水草缺乏其中某種元素，也會導致植株的發育不良。壹般來說，在缺乏某種元素的情況下，水草很難或無法吸收其它的元素；反之，某些元素過量時，同樣也無法吸收其它的元素。
按水草需求不同分為：磷肥、氮肥、鉀肥、微量元素，下面簡單介紹壹下這幾種肥料的作用。
（1）磷肥
磷參與了植物細胞內的物質代謝和能量代謝，促進植物的正常生長發育，尤其是根的早期發育。在此，施用適量的磷肥，可促使水草早期根系發育。
當缺磷時，水草的根部乃至整個植株，生長發育受到抑制，葉片表現為暗綠色或暗灰色，水中磷肥過多，可促使藻類大量繁殖，對水草的生長發育不利，所以施用磷肥時，要適時適量為宜。
（2）氮肥
氮可以制造植物的細胞，是葉綠素的組成部分，它能活躍植物體中多種生理活動的進程，使植物較長暑期地保質旺盛的生命活動。因此，適當地增施氮肥，可促進植物的光合作用，延長水草葉片的壽命。
壹般在氮素不足的情況下，植物體中含氮量降低，生長也衰弱，影響了葉片的發育，葉片則呈現淡綠色；當大量缺氮時，葉幾乎呈黃色或葉脈呈淡約色，新葉也明顯縮小，但氮素過多時，植株會發生徒長，容易呈現倒狀。
（3）鉀肥
鉀能促進植物體內的碳酸同化作用。有鉀時，水草加強了對氮的吸收，促進含氮化合物的形成，使植株生長強壯。
當缺鉀時，水草下部的葉片出現紅紫色或紅褐色的斑點，葉尖或葉緣開始變黃，此後漸變成褐色，植株莖枝的節間也短，除此之外，缺鉀還會使新長出的嫩芽變淡發白，抑制葉綠素的形成。因而，要適當施用與氮和磷相混合的肥料，才能使水草正常地生長發育。