1、具備資格要求：申請人必須是依法設立並具備獨立法人資格的企事業單位，或者依法在行政區域內註冊登記並取得經營許可證的個體工商戶。
2、準備申請資料：申請人需要準備相關申請資料，包括企業法人營業執照、醫療器械經營企業許可證、醫療器械質量管理規範認證證書等。
3、在線申請：申請人需要登錄國家藥品監督管理局醫療器械經營許可證網上申請系統，填寫相關信息並上傳申請材料。
4、現場審核：申請人提交申請後，相關部門會對申請人的場所、質量管理體系、業務範圍等進行現場審核。
5、審核結果：審核通過後，申請人需要繳納相應的費用，並領取二級醫療器械經營許可證。若審核不通過，申請人可以在規定時間內重新申請，或者提出復議申請。
二級醫療器械經營許可證申請需要的資料如下：
1、申請表：填寫二級醫療器械經營許可證申請表；
2、營業執照：提供公司的營業執照副本；
3、法定代表人身份證明：提供法定代表人的身份證明文件，例如身份證、護照等；
4、經營場所證明：提供經營場所的產權證、租賃合同等證明材料；
5、企業資質證明：提供企業資質證明，如醫療器械質量管理體系認證證書等；
6、員工證明：提供員工的資格證明和培訓證明等相關材料；
7、質量控制手冊：提供質量控制手冊等質量管理文件。
綜上所述，申請人在申請時應遵守相關法律法規，確保申請材料真實有效，並且設立的經營場所符合規定的要求。
法律依據：
《中華人民***和國醫療器械監督管理條例》第三十壹條
從事第三類醫療器械經營的，經營企業應當向所在地設區的市級人民政府食品藥品監督管理部門申請經營許可並提交其符合本條例第二十九條規定條件的證明資料。
受理經營許可申請的食品藥品監督管理部門應當自受理之日起30個工作日內進行審查，必要時組織核查。對符合規定條件的，準予許可並發給醫療器械經營許可證；對不符合規定條件的，不予許可並書面說明理由。
醫療器械經營許可證有效期為5年。有效期屆滿需要延續的，依照有關行政許可的法律規定辦理延續手續。