1.綜合協調本局日常事務，制定本局工作制度。
2 .負責領導批示和其他重要政務工作的督辦。3.負責會議、秘書、文電、機要、檔案、保密、信訪、值班、安全等工作。
4.組織代表建議和CPPCC委員提案辦理工作。
5.負責新聞宣傳和報紙、期刊、圖書的管理。
6.負責中醫藥、政務公開、電子政務和政府網站的信息化建設。
7.組織協調中醫藥文化傳承發展和中醫藥科學普及的相關工作。
8.指導中國中醫藥年鑒的編輯工作。
9 .承擔中醫藥部際協調機制的具體工作。
10.承擔領導交辦的其他任務。主要職責
1.制定並組織實施中醫藥人才發展規劃和中醫藥專業技術人員資格標準。
2 .負責局機關的人事工作，指導局機關直屬單位的人事工作。
3.負責局機關和直屬單位幹部教育培訓工作，指導和協調全國中醫藥管理幹部培訓工作。
4.擬定中醫藥繼續教育和師承教育發展規劃，並組織實施。
5 .指導中醫藥教師教育、畢業後教育、繼續教育及相關人員培訓。
6.參與中醫藥教育教學改革、中醫藥教育發展規劃、中醫藥教育機構設置標準等相關專業標準的起草。
7 .中醫藥職業技能教育培訓管理。
8 .引導國家政府認可中醫藥體系。
9 .指導、聯系相關中醫藥社會團體。
10.負責離退休幹部工作。
11.承擔領導交辦的其他任務。主要職責
1.負責起草中醫藥中長期發展規劃。
2 .負責中央財政、基建、項目等資金的安排和監管。
3.組織協調中藥資源普查工作。
4 .參與制定中醫藥產業發展規劃和產業政策。
5.參與醫療服務價格、藥品價格、基本醫療保險費用等政策研究。
6 .指導中醫藥統計工作，制定中醫藥統計調查制度並組織實施。
7.承擔部門預算、決算、財務和國庫管理工作。
8.承辦局直屬單位基本建設項目的審核或審批。
9.組織協調扶貧、援藏和對口支援工作。
10.負責審批國有資產和進口儀器設備，制定相關制度。
11.承擔本局的財務結算工作。
12.承擔領導交辦的其他任務。主要職責
1.制定中醫藥發展戰略和政策，組織中醫藥重大理論和實踐問題的調查研究，提出相關政策建議。
2.組織起草與中醫藥相關的法律、法規和部門規章。
3.審查承辦機關相關規範性文件的合法性。
4.組織中醫藥行業法制宣傳教育。
5.承辦相關的行政復議和行政訴訟。
6 .歸口管理中醫藥標準化相關工作。
7 .中醫藥綜合管理執法監督。
8 .監督和指導中醫醫療廣告的審查工作。
9.規範中醫醫療服務秩序，督辦中醫非法行醫大案要案。
10.承擔領導交辦的其他任務。主要職責
1.制定中醫藥、中西醫結合、民族醫藥和醫療保健機構及其技術應用的管理規範和標準，並組織實施，指導其他醫療機構的中醫藥業務。
2.制定中醫、中西醫結合和民族醫療機構醫療質量控制和醫療服務管理的標準、規範和政策並組織實施，建立醫療質量控制和醫療服務監管體系及其評價體系，組織對醫療質量、安全和服務進行評價、檢查和監督。
3.制定中醫藥防治重大疾病的規劃並組織實施。
4.參與突發公共衛生事件應急醫療救治的組織和協調。
5 .制定中醫重點專科建設的規劃、標準和政策並指導實施。
6.擬定中醫診療常規、入院標準、用藥指南和臨床診療路徑。
7.擬訂中醫護理管理的法規、標準和政策並指導實施。
8.研究和規範我國醫療機構的藥事管理。
9.制定中醫醫療保健人員資格標準和服務標準並監督實施。10.指導和組織實施農村中醫藥衛生和社區衛生服務，支持農村中醫藥事業。
11.負責基層中醫藥適宜技術的推廣。
12.參與國家基本藥物目錄制定的相關工作。
13.參與制定中醫藥臨床試驗和中醫診療設備管理的法律、法規和政策並指導實施。
14.承擔領導交辦的其他任務。主要職責
1.制定中醫藥科學研究和技術開發計劃並組織實施。
2 .指導國家中醫藥創新體系建設。
3.組織實施中醫藥重點科技項目。
4.組織中醫藥適宜技術的篩選和研究。
5.組織中醫藥新技術評價，促進中醫藥科技成果轉化、應用和推廣。
6.負責中醫文獻、秘方、驗方的免費捐贈、篩選和評估。
7 .指導中西醫結合和民族醫藥研究。
8 .指導中醫藥科研條件和科技能力建設，以及國家中醫藥臨床研究基地、重點研究實驗室和科研實驗室建設。
9 .指導中醫藥學術交流，促進中醫藥科研知識產權保護。
10.指導中醫藥行業科學技術獎勵工作。11.承擔領導交辦的其他任務。(港澳臺辦公室)
主要職責
1.擬訂中醫藥國際交流與合作計劃，並組織實施。
2.研究國際中醫藥發展現狀，制定相關政策。
3.組織和指導中醫藥領域的多邊和雙邊官民交流與合作。
4.負責與世界衛生組織等國際組織的交流與合作。
5.組織、協調和實施中醫藥國際合作重點項目。
6 .指導中醫藥服務貿易發展並制定相關政策。
7 .引導中醫藥文化的海外傳播。
8 .指導和組織內地與港澳臺的中醫藥交流與合作。
9.負責總局機關和直屬單位的外事工作，指導總局業務主管的社會團體開展國際交流與合作。
10.承擔領導交辦的其他任務。主要職責
1.負責局機關和直屬單位的黨群工作。
2.組織黨的宣傳、組織、統戰、維穩、精神文明建設和教育，培養和管理黨員。
3.指導直屬機關紀律檢查委員會的工作，檢查處理黨組織和黨員違反黨的紀律和規定的案件，受理黨員的檢舉、控告和申訴。
4.指導直屬機關工會、團委、婦工委等群眾團體按照各自的章程獨立開展工作。
5 .協助人事部門開展黨員黨校領導幹部培訓。
6.承辦領導交辦的其他工作。