適應癥 在臨床上的用途主要是：(1)搶救感染中毒性休克：成人每次1～2mg，小兒0.03～0.05mg/kg，靜註，每15～30分鐘1次，2～3次後如情況不見好轉可逐漸增加用量，至情況好轉後即減量或停藥。(2)治療銻劑引起的阿-斯綜合征：發現嚴重心律紊亂時，立即靜註1～2mg(用5%～25%葡萄糖液10～20ml稀釋)，同時肌註或皮下註射1mg，15～30分鐘後再靜註1mg。如病人無發作，可根據心律及心率情況改為每3～4小時皮下註射或肌註1mg，48小時後如不再發作，可逐漸減量，最後停藥。(3)治有機磷農藥中毒：①與解磷定等合用時：對中度中毒，每次皮下註射0.5～1mg，隔30～60分鐘1次；對嚴重中毒，每次靜註1～2mg，隔15～30分鐘壹次，至病情穩定後，逐漸減量並改用皮註。②單用時：對輕度中毒，每次皮下註射0.5～1mg，隔30～120分鐘1次；對中度中毒，每次皮下註射1～2mg，隔15～30分鐘1次；對重度中毒，即刻靜註2～5mg，以後每次1～2mg，隔15～30分鐘1次，根據病情逐漸減量和延長間隔時間。(4)緩解內臟絞痛：包括胃腸痙攣引起的疼痛、腎絞痛、膽絞痛、胃及十二指腸潰瘍，每次皮下註射0.5mg。(5)用為麻醉前給藥：皮下註射0.5mg，可減少麻醉過程中支氣管粘液分泌，預防術後引起肺炎，並可消除嗎啡對呼吸的抑制。(6)用於眼科：可使瞳孔放大，調節功能麻痹，用於角膜炎、虹膜睫狀體炎。用1%～3%眼藥水滴眼或眼膏塗眼。滴時按住內眥部，以免流入鼻腔吸收中毒。
抗M-膽堿藥。①用於胃腸道功能紊亂，有解痙作用，對膽絞痛、腎絞痛效果不穩定；②用於急性微循環障礙，治療嚴重心動過緩，暈厥合並頸動脈竇反射亢進以及Ⅰ度房室傳導阻滯；③作為解毒劑，可用於銻劑中毒引起的阿－斯綜合征、有機磷中毒以及急性毒蕈中毒；④用於麻醉前以抑制腺體分泌，特別是呼吸道粘液分泌；⑤可減輕帕金森癥患者強直及震顫癥狀，並能控制其流涎及出汗過多；⑥眼科用於散瞳，並對虹膜睫狀體炎有消炎止痛之效。
註意事項 (1)常有口幹、眩暈，嚴重時瞳孔散大、皮膚潮紅、心率加快、興奮、煩躁、譫語、驚厥。(2)青光眼及前列腺肥大病人禁用。(3)壹般情況下，口服極量，1次1mg，1日3mg；皮下或靜脈註射極量，1次2mg。用於有機磷中毒及阿-斯綜合征時，可根據病情決定用量。
中毒解救用量超過5mg時，即產生中毒，但死亡者不多，因中毒量(5～10mg)與致死量(80～130mg)相距甚遠。急救口服阿托品中毒者可洗胃、導瀉，以清除未吸收的阿托品。興奮過於強烈時可用短效巴比妥類或水合氯醛。呼吸抑制時用尼可剎米。另外可皮下註射新斯的明0.5～1mg，每15分鐘1次，直至瞳孔縮小、癥狀緩解為止。
禁用慎用
(1)對其他顛茄生物堿不耐受者，對本品也不耐受。
(2)孕婦靜脈註射阿托品可使胎兒心動過速。
(3)本品可分泌入乳汁，並有抑制泌乳作用。
(4)嬰幼兒對本品的毒性反應極為敏感，特別是痙攣性麻痹與腦損傷的小兒，反應更強，環境溫度較高時，因閉汗有體溫急驟升高的危險，應用時要嚴密觀察。
(5)老年人容易發生抗 M-膽堿樣副作用，如排尿困難、便秘、口幹(特別是男性)，也易誘發未經診斷的青光眼，壹經發現，應即停藥。本品對老年人尤易致汗液分泌減少，影響散熱，故夏天慎用。
(6)下列情況應慎用：①腦損害，尤其是兒童；②心臟病，特別是心律失常、充血性心力衰竭、冠心病、二尖瓣狹窄等；③返流性食管炎、食管與胃的運動減弱、下食管括約肌松弛，可使胃排空延遲，從而促成胃瀦留，並增加胃-食管的返流；④青光眼患者禁用，20歲以上患者存在潛隱性青光眼時，有誘發的危險；⑤潰瘍性結腸炎，用量大時腸能動度降低，可導致麻痹性腸梗阻，並可誘發加重中毒性巨結腸癥；⑥前列腺肥大引起的尿路感染(膀胱張力減低)及尿路阻塞性疾病，可導致完全性尿瀦留。
青光眼及前列腺肥大者禁用. 中毒解救 用量超過5mg時，即產生中毒，但死亡者不多，因中毒量(5～10mg)與致死量(80～130mg)相距甚遠。急救口服阿托品中毒者可洗胃、導瀉，以清除未吸收的阿托品。興奮過於強烈時可用短效巴比妥類或水合氯醛。呼吸抑制時用尼可剎米。另外可皮下註射新斯的明0.5～1mg，每15分鐘1次，直至瞳孔縮小、癥狀緩解為止。