這是因為藥物開發過程耗費大量時間和資源，而且存在很多不確定因素。通過預測，可以提前了解藥物分子與受體的相互作用，確定其對目標疾病的治療效果，並預測藥物的毒性和副作用，從而避免在後續研究中出現嚴重問題。
預測是計算機輔助藥物設計的重要方法之壹，可以大大縮短和優化藥物開發周期。通過計算機模擬，可以快速評估藥物分子的性質、構象、穩定性和其他重要參數。預測還可以幫助藥物研究人員優化藥物分子結構，提高藥物代謝的穩定性，從而提高藥物療效，減少副作用。
總之，計算機輔助藥物設計的基本目標之壹就是預測藥物分子的性質及其與受體的相互作用，從而提高研發效率和成功率，降低研發成本和副作用。
計算機輔助藥物設計的基本目標包括：
1.
1、預測藥物分子結構：通過計算機模擬找出藥物分子合適的空間構型。
2、預測藥物-受體結構：模擬藥物靶點分子在體內的作用，對於具有競爭效力的藥物，可以對照靶點的結構進行拍照，評估結構/功能影響。?
3、優化藥物分子結構：通過設計新化合物來改善藥物分子的特性，如增加藥物與受體之間的親和力、降低藥物的慢性毒性等？
4、優化藥物代謝穩定性：通過計算機模擬藥物分子與代謝酶的相互作用，從而設計合成不易被代謝酶破壞和酶純化的藥物代謝產物。
5、預測藥物毒性：通過計算機輔助，預測藥物的穩定性和毒性，從而避免副作用。