HIS系統即醫院信息系統(全稱為Hospital Information System)。在國際學術界，它已被公認為是新興的醫學信息學的重要分支。HIS系統的有效運行，將提高醫院各項工作的效率和質量，促進醫學科研、教學;減輕各類事務性工作的勞動強度，使他們騰出更多的精力和時間來服務於病人;改善經營管理，堵塞漏洞，保證病人和醫院的經濟利益;為醫院創造經濟效益。
醫療HIS系統大體可以分為以下三個階段：
1.管理信息系統
管理信息系統壹般包括：
門、急診掛號子系統
門、急診病人管理及計價收費子系統
住院病人管理子系統
藥庫、藥房管理子系統
病案管理子系統
醫療統計子系統
人事、工資管理子系統
財務管理與醫院經濟核算子系統
醫院後勤物資供應子系統
固定資產、醫療設備管理子系統
院長辦公綜合查詢與輔助決策支持系統
2.臨床醫療信息系統
臨床醫療信息系統可能包括的內容很多，甚至可能是專科、專病、專課題的信息處理系統，下面給出壹些常見系統的例子：
住院病人醫囑處理子系統
護理信息系統
門診醫生工作站系統
臨床實驗室檢查報告子系統
醫學影像診斷報告處理系統
放射科信息管理系統
手術室管理子系統
功能檢查科室信息管理子系統
病理卡片管理及病理科信息系統
血庫管理子系統
營養與膳食計劃管理子系統
臨床用藥咨詢與控制子系統
3.醫院信息系統的高級應用
醫學圖像實時傳輸與查詢、歸檔系統
(PictureArchivingandCommunicationSystem,PACS)
病人床邊信息系統
計算機化的病人病案系統(CPR)
科研支持系統
教學支持系統
Internet醫學情報系統
遠程診斷與教學，HIS系統大概就是這些模塊的系統