對照是比較的前提，為了消除無關因素對實驗結果的影響，實驗中必須設置對照組，以保證實驗結果的可比性和實驗結論的正確性，對照應符合齊同可比的原則，除供試藥物和處理方法不同外，實驗動物要求性別、年齡、體重相同，實驗室溫度控制應壹致，也需要相同的操作技術。溫度控制要壹致，還需要相同的操作技術，根據實驗研究目的和需要的不同，常有正常對照、陽性對照、陰性對照、自我對照等對照方法。
在壹些涉及免疫學或抗體的實驗中，往往需要加入同型對照，即同型抗體對照。同型抗體是壹種非特異性抗體，與實驗組的第壹抗體具有相同的動物來源（小鼠等）和相同的抗體類別（IgG1、IgG2、IgG4 等）。例如，在下圖中，我們 Biosetu 向純合 h4-1BB 小鼠註射了 IgG4 抗 h4-1BB 抗體。在給藥的第 14 天和第 21 天采集血樣，並通過血液生化測試進行分析。
2.隨機化（randomization）原則
隨機化（randomization）是指按照機會均等的原則進行抽樣或分組，使每個受試者被分配到各組的機會均等，不受主觀因素的影響。其目的是盡量減少各種幹擾因素造成的實驗誤差，而不受實驗者主觀因素或其他偏差的影響。
1）簡單隨機：按照隨機性原則對所有個體（動物）進行取樣和分配，這是最簡單、最基本的取樣方法，不考慮樣本之間的任何關系，完全隨機地按順序取樣，這種方法在藥理學中較少使用；
2）均衡隨機：首先將容易控制、對實驗影響較大的因素作為分層指標，人為地使各組在這些指標上達到均衡壹致，則各組達到均衡壹致的機會較大。在這些指標達到均衡壹致後，再根據隨機原則將個體分配到各組中，力求年齡、性別、病情輕重等構成比例基本壹致。這種方法常用於藥理學。
例如，動物實驗中的隨機化方法有抽簽法、傾倒法、隨機數字表法等。將n個受試者按腫瘤大小編號排序，平均分為5組，受試者可按甩尾方式分組，每組6個樣本，力求在隨機原則的情況下各項指標能達到均衡效果。