企業初創期，除了普惠式的稅收優惠，重點行業的小微企業購置固定資產，特殊群體創業或者吸納特殊群體就業（高校畢業生、失業人員、退役士兵、軍轉幹部、隨軍家屬、殘疾人、回國服務的在外留學人員、長期來華定居專家等）還能享受特殊的稅收優惠。同時，國家還對扶持企業成長的科技企業孵化器、國家大學科技園等創新創業平臺、進行非貨幣性資產投資的創投企業、金融機構、企業和個人等給予稅收優惠，幫助企業聚集資金。
為營造良好的科技創新稅收環境，促進企業快速健康成長，國家出臺了壹系列稅收優惠政策幫助企業不斷增強轉型升級的動力。對研發費用實施所得稅加計扣除政策。對企業固定資產實行加速折舊，尤其是生物藥品制造業、軟件和信息技術服務業等6個行業、4個領域重點行業的企業用於研發活動的儀器設備不超過100萬元的，可以壹次性稅前扣除。企業購買用於科學研究、科技開發和教學的設備享受進口環節增值稅、消費稅免稅和國內增值稅退稅等稅收優惠。幫助企業和科研機構留住創新人才，鼓勵創新人才為企業提供充分的智力保障和支持。
發展壯大有成長性的企業，同樣具有稅收政策優勢，國家充分補給“營養”，助力企業枝繁葉茂、獨木成林。目前稅收優惠政策覆蓋科技創新活動的各個環節領域，幫助搶占科技制高點的創新型企業加快追趕的步伐。對高新技術企業減按15%的稅率征收企業所得稅，並不斷擴大高新技術企業認定範圍。對處於服務外包示範城市和國家服務貿易創新發展試點城市地區的技術先進型服務企業，減按15%的稅率征收企業所得稅。對軟件和集成電路企業，可以享受“兩免三減半”等企業所得稅優惠，尤其是國家規劃布局內的重點企業，可減按10%的稅率征收企業所得稅。對自行開發生產的計算機軟件產品、集成電路重大項目企業還給予增值稅期末留抵稅額退稅的優惠。
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