第壹案：歌劇院的幽靈
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，結成英作（因為他在後來還出場過，就算作主要人物之壹，法醫）
兇手：有森裕二（動畫：神矢修壹郎）
死者：
1．日高織繪，被吊燈壓死
2．桐生春美，吊死
3．緒方夏代，砸死
4．有森裕二，毒箭射死（自殺）
第二案：異人館村殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，表田孝太郎
兇手：小田切進（六星龍壹），時田若葉，風祭淳也
死者：
1．六星詩織，作為最後的殺人訓練，讓六星龍壹殺死了自己
2．小田切進，被六星龍壹殺掉後交換身份，屍體埋於深山
3．兜麗子，頭被切下後屍體轉移（被時田若葉殺死後偽裝成自己的屍體）
4．時田若葉，先被勒死，後頭被切下，屍體放置於兜麗子死的床上（自願被愛人殺死）
5．壹色寅男，先被刺穿心臟，後右腿被切下，死於自家冰箱
6．草剃三子，左腿被砍下，死於自家
7．時田十三，心臟病死亡
8．五塔蘭，左肩至左手被切下，後被自家大火燒死
9．兜禮二，兇手真面目被揭發出來後，被兇手手中獵槍殺死
10．連成久彥，為了替未婚妻時田若葉報仇與六星龍壹搏鬥時，被六星龍壹的獵槍打死
11．六星龍壹，被自己的親生父親風祭淳也用獵槍大義滅親
12．風祭淳也，守著自己兒子的屍體自焚在了大麻田中
第三案：雪夜叉傳說殺人事件
主角：金田壹壹，速水鈴香，明智健悟，劍持勇
兇手：綾辻真理奈
死者：
1．明石道夫，鐵鍬重擊後腦
2．加納理惠，劈死
3．比留田雅誌，劈死
4．冰室壹聖（水沼隆夫），毒死，偽裝成畏罪自殺
第四案：學園七不可思議殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，佐木龍太，真壁誠，鷹島友代（這兩人因後來短篇集和壹些小故事還有出場，故放於主角型人物，以後也相同，只要長期運用的人物，即都以主角型人物處理）
兇手：的場勇壹郎，立華良造（青山良造）
死者：
1．青山千裕，與兇手爭執時不小心摔下樓梯
2．櫻樹琉璃子，吊死
3．尾之上貴裕，鐵錘打死後吊在樹上
4．的場勇壹郎，揭穿真相後被立華良造刺死
第五案：秘寶島殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，茅杏子
兇手：美作碧（佐伯航壹郎）
死者：
1．美作碧，得知戀人佐伯航壹郎的父親被自己父親所害時割腕自殺
2．美作大介，被分屍放於座鐘內
3．柿本麻人，分屍
4．八十島隆造，分屍後房屋被燒毀
5．火村康平，因發現兇手的秘密被槍擊而死
6．矢荻久義，在找到財寶之前被兇手搶先殺死
7．巖田英作，被財寶壓死（與佐伯航壹郎無關）
第六案：悲戀湖殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，五木陽介，遠野英治
兇手：遠野英治
死者：
1．小泉螢子，海難中因甲田征作（名字縮寫為S.K.）丟下不顧而去而淹死（後幾名死者名字縮寫均為S.K.）
2．倉田壯壹，被斧頭劈中頭部，後臉部被剁爛
3．香山三郎，劈死後臉部被剁爛
4．遠野英治（橘川茂），劈死後臉部被剁爛，偽裝成遠野英治的屍體
5．小林星二，頭部挨了壹斧頭
第七案：異人館旅館殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍太（後死亡，動畫中未死），表田孝太郎（動畫中未出場），劍持勇，明智健悟（後兩人短期登場）
兇手：不破鳴美（北見蓮子）
死者：
1．不破鳴美，跳海自殺，被北見蓮子發現其證件後交換身份
2．萬代鈴江，推理劇公演中被毒死
3．虹川幸雄，刺死後放於冰湖
4．佐木龍太，拍到了不該拍到的東西，被兇手勒死在金田壹的屋子裏（動畫中未死）
5．文月花蓮（北見花江），被兇手毒死，偽裝成畏罪自殺
第八案：絞首之學院殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，千家貴司，森宇多子，劍持勇
兇手：淺野遙子
死者：
1．室井矢壹，吊死
2．古谷直樹，吊死
3．仁藤伸幸，吊死，兇手留下偽造的遺書
第九案：飛驒機關宅邸殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：巽紫乃，巽龍之介
死者：
1．巽征丸，頭被割下
2．仙田猿彥，因槍筒灌鉛，開槍時槍支爆炸而死
3．巽紫乃，被巽龍之介誤毒死
第十案：金田壹少年的殺人
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二，五木陽介，劍持勇，明智健悟，長島滋
兇手：都築哲雄
死者：
1．橘五柳，兇手與死者爭吵，壹怒之下打死死者，嫁禍給金田壹
2．大村紺，和金田壹通話時被高爾夫球棒打死，嫁禍給金田壹
3．時任亙，被金田壹問話時被鋼材壓死，嫁禍給金田壹
4．桂橫平，被金田壹問話時在帳篷中刺死，嫁禍給金田壹
5．野中友美，金田壹問完話後，被兇手刺死，仍嫁禍金田壹
6．都築哲雄，最後自知罪孽深重自殺
第十壹案：塔羅山莊殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，速水玲香，結成英作
兇手：速水雄壹郎，小城拓也
死者：
1．伊丹吾郎，煙灰缸打死
2．赤間光彥，電死
3．速水雄壹郎，勒死，偽裝成自殺
4．小城拓也，為救玲香被雪崩吞沒
第十二案：蠟人形城殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，明智健悟
兇手：多岐川穗
死者：
1．狹山恭次，三名死者因為貪念，殺了狹山
2．當麻惠，後背被刺入匕首失血過多而死
3．理查德·安德森，被鐵處女刺死
4．阪東九三郎，與蠟像壹樣比擬被吊死
5．多岐川穗，最後事情敗露，與蠟人形館焚於大火
第十三案：怪盜紳士的殺人
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，怪盜紳士，大河內善助
兇手：和泉櫻
死者：
1．和泉宣彥，被蒲生和海津兩人利用並迫害而死
2．海津裏美，隨著以其做模特的裸體畫被取走，其裸體屍體被發現於瀑布池
3．蒲生剛三，隨著以其做模特的釣魚像被取走，其屍體被發現於山崖下
4．和泉櫻，揭開謎底後自殺
第十四案：墓場島殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二
兇手：檜山達之，森下麗美
死者：
1．井阪、河野、守屋，炸彈炸死
2．萩園哲範，刺刀刺死
3．難波昌平，被刺死
4．米村，毒死
5．檜山達之，被認定是兇手後，為了洗脫森下麗美的嫌疑自殺
第十五案：魔術列車殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二，劍持勇，明智健悟，高遠遙壹
兇手：高遠遙壹，近宮玲子
死者：
1．近宮玲子，摔死
2．紳士山神，太陽穴被插入刀，身體被分屍
3．貴公子由良間，胸部中刀立斃
4．美人魚夕海，被吊死在樹上
5．小醜左近寺，燒死在舞臺上（因近宮玲子的缺陷魔術而死）
第十六案：黑死蝶殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，五木陽介，速水玲香（短期），遠野英治（深山日影）
兇手：小野寺將之（須賀徹）
死者：
1．斑目琉璃（兇手妹妹），被兇手殺死，後棄屍於蝶冢，用特別手法掩藏
2．斑目館羽（兇手妹妹），被兇手殺死，後被固定於破裂的溫室玻璃上
3．斑目紫紋，被兇手殺死，後固定於墻上
4．小野寺將之和斑目綠，真相大白後自焚
第十七案：法蘭西銀幣殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：鳥丸奈緒子，高森益美
死者：
1．廣誌，高森益美以前的男友，被益美打暈後給鳥丸奈緒子殺死
2．六條光彥，毒死
3．犬飼要介，毒死
4．霧山小夜子，槍擊死
第十八案：魔神遺跡殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二
兇手：村西彌生
死者：
1．宗像今日子，和兇手在樓梯爭執時不慎摔下樓梯
2．大河猛，絞死
3．港屋寬壹，頭部削落（意外，但主要原因是兇手的爆炸）
4．蘇我豐廣，敲死
5．村西彌生，因絕癥死亡
第十九案：速水玲香誘拐事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，速水玲香，劍持勇，高遠遙壹
兇手：安岡真乃美，高遠遙壹
死者：
1．安岡保之，被安岡真奈美槍殺
2．安岡真乃美，因計劃失敗被高遠遙壹毒死（高遠遙壹從金田壹眼皮底下逃脫） 新版第壹案：魔犬森林殺人事件（動畫版為“魔犬森林的殺人”）
主角：金田壹壹，七瀨美雪，千家貴司，劍持勇，金田壹二三（後二人短期登場）
兇手：千家貴司
死者：
1．水澤利緒，千家的女友，被三名死者和百田梅南四人做藥品試驗而導致其提前病死
2．三道麻衣，被殺後，被做成被塞伯拉斯咬死狀
3．萬屋透，早晨被兇手殺害後，偽裝成被塞伯拉斯咬死，並混淆死亡時間，讓大家認為在釘門窗時死的
4．渡邊鐘，先被兇手斧擊而死，後偽裝成被塞伯拉斯咬死，但死者留下了死亡訊息
新版第二案：銀幕之殺人鬼
主角：金田壹壹，七瀨美雪，金田壹二三，佐木龍二，速水鈴香（短期登場）
兇手：遊佐知惠美
死者：
1．本多影行，墮樓身亡
2．泉谷繁樹，殺死後全身纏繞膠片懸掛於舞臺頂架。
3．真田廣誌，後腦被重擊
4．門脅靖浩，腹部被刺中
5．藏澤光，被毒死
新版第三案：天草財寶傳說殺人事件
主角：金田壹壹，美浦愛咪，五木陽介，七瀨美雪
兇手：和田守男
死者：
1．中田絹代，丁字鎬擊腦而死，後被裸體放在女子澡堂
2．赤峰藤子，被丁字鎬打死
3．赤門秀明，被丁字鎬打死
4．最上葉月，被註射毒液，偽裝成自殺
新版第四案：雪影村殺人事件
主角：金田壹壹，（動畫中七瀨美雪在個別並未描述事件的鏡頭中短期登場）
兇手：島津匠
死者：
1．社冬美，脖子被插“上送箭”
2．蓮沼綾花，脖子被插“上送箭”
新版第五案：露西亞人偶殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二，高遠遙壹
兇手：桐江想子
死者：
1．山之內垣聖，病逝
2．神明忠治，砸死後身首分離
3．寶田光二，刺死後身首分離
4．幽月來夢，勒死後身首分離
新版第六案：怪奇馬戲團殺人
主角：金田壹壹，七瀨美雪，金田壹二三，劍持勇
兇手：小京顯人，小京乃繪留
死者：
1．梅花艾德（小平大樹），被勒死後被壓在油桶下面
2．黑桃山姆（榎本武史），在金田壹眼皮底下死去，兇手“火焰MONSTER”在密室中消失
最後壹案：金田壹少年敢死之行（又稱：金田壹少年決死行）
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二，五木陽介，明智健悟，劍持勇，高遠遙壹，速水鈴香，李波兒，楊小龍（這兩人雖然是小說人物，漫畫迫不得已出場，也算作主角），怪盜紳士，豬川將佐，長島滋，茅杏子，表田孝太郎（後幾人在金田壹籌款時出現）
兇手：周龍道（狩谷純），高遠遙壹
死者：
1．狩谷周平，被四名死者推入洞窟中活埋
2．神山，在懺悔後被高遠遙壹毒死
3．藤井文香，偽裝成紅衣女子，被殺死在黃龍酒店舊館二樓
4．四之宮徹，在暗洞裏被周龍道割喉，嫁禍給金田壹
5．松岡修治，被周龍道用槍殺死，嫁禍給金田壹
從此單行本完結，金田壹壹個人出去旅行 2004年時，出了壹個單獨的故事《吸血鬼傳說殺人事件》。
吸血鬼傳說殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：湊青子
死者：
1． 海谷朝香，被勒死，血液抽幹
2． 二神育夫，頭部致命， 血液抽幹
2005年出了《歌劇院第三次殺人事件》。
歌劇院第三次殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，明智健悟（結尾處），高遠遙壹（結尾處提到）
兇手：湖月鈴央奈
死者：
1．繪門泉，吊燈砸死
2．三鬼谷巧，被兇手在右臂紮入毒針，死後被砍下左手
3．城龍也，刺死
獄門塾殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，村上草太，劍持勇，明智健悟，高遠遙壹
兇手：濱秋子，氏家貴之，高遠遙壹
死者：
1．藍野修治，藥劑被六名被害人欺騙濱秋子將其掉包導致惡疾發作死亡
2．茂呂井連，毒殺
3．近衛元彥，毒殺，死後偽裝成化學上燃燒的比擬殺人
4．海堂瞳，毒殺，死後偽裝成DNA雙螺旋結構的比擬殺人
5．繪波由梨香，毒殺，死後偽裝成《竹取物語》的比擬殺人
6．鯨木大介，毒殺，死後偽裝成陀思妥耶夫斯基《群魔》的比擬殺人
7．霧澤透，毒殺，並偽裝成畏罪自殺
8．氏家貴之，金田壹揭露真相後被高遠用薔薇刺死
雪靈傳說殺人事件
兇手：黑沼繁樹，堂崎次生
死者：
1．瀨倉未沙，在雪地中冰凍後被電鋸分屍
2．鱒井涉，胸部被插入冰斧
3．堂崎壹誌，胸部被堂崎次生插入冰斧
4．堂崎次生，被冰斧打死
不動高中學園祭殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，村上草太，劍持勇
兇手：津雲成人
死者：
1．伊誌田純，遭殺害後被兇手穿上女仆裝
血溜之間殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：海峰學
死者：
1．星桂馬，重擊頭部後砍頭
黑魔術殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，高遠遙壹（黑瓜鬼門），井澤研太郎（小說出現過）
兇手：高遠遙壹，井澤研太郎
死者：
1．黑瓜鬼門，被高遠殺死後交換身份
2．火祀青龍，躺上軌道被火車撞死
3．火祀九曜，電線絞死
4．火祀曉，溺死
劍持警部殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，明智健悟，高遠遙壹（後面出現）
兇手：毒島睦
死者：
1．十神真理奈，被魚崎平和多間木匠迫害致死
2．魚崎平，浴缸裏淹死
3．多間木匠，燒死
煉金術殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，速水玲香，怪盜紳士
兇手：神丘風馬
死者：
1．繭村琢也，胸口被大劍刺死
2．深森螢，胸口被大劍刺死
3．鬼澤龍子，脖子被大劍刺死
4．不二森映，被灌銀花瓶砸死
遊戲館殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：麥林美佳（菊川早苗）
死者：
1．霜村誌保，炸彈炸死
2．霜村生馬，毒死
食人研究所殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪
兇手：中神深誌
死者：
1．鱷部銳介，摔死，偽裝自殺
2．麻木根部，被剃刀割死，偽裝自殺
3．財前乙彥，房間充滿二氧化碳導致窒息身亡
暗黑城殺人事件
兇手：桐森蘭
死者：
1．桐森嶽誌，註射毒藥死亡
香港九龍財寶殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，佐木龍二
兇手：楊蘭
死者：
1．王龍，被背叛自己的三名死者殺死
1．陳永福，毒死
2．新力，煙灰缸敲死
3．柳愛碧，玻璃碎片割死
薔薇十字館殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，高遠遙壹
兇手：月讀吉賽爾
死者：
1．皇翔，推下樓死亡，然後分屍，屍體在碟子上
2．小金井睦，毒薔薇毒死
3．祭沢壹心，剪刀刺死，然後固定在密室上
4．襌田美琉久，十字弓箭從後背射死
雪鬼傳說殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪
兇手：月見裏光
死者：
1．雲澤夏樹 ，在冰下淹死
2．鯖木海人，被菜刀砍死
高遠遙壹少年事件簿
主角：高遠遙壹，明智健悟（後面出現）
兇手：霧島純平，高遠遙壹
死者：
1．藤枝椿，勒死後砍頭，她的死改變了高遠性格
2．黑江真砂也，砍頭
3．霧島純平，想殺高遠結果被反殺了
亡靈校舍的殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，明智健悟，劍持勇，高遠遙壹
兇手：遠間萌黃
死者：
1．鬼城步夢，喉嚨被刀刺穿
2．花泉響也，被刀刺死
3．矢森雪雄，從走廊破洞跌落而淹死
狐火漂流殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪
兇手：神小路陸
死者：
1．月江茉莉香，刀刺，因身上沾到兇手血跡而被打扮成“出嫁的狐仙”
2．乾光太郎，刀刺
3．霧谷凜，刀刺
蟻地獄壕殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，高遠遙壹
兇手：舞谷楓
死者：
1．彩世泉，刺死
2．華形拓人，睡覺時刺死
吸血櫻殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，佐木龍二
兇手：葉崎栞（青桐夏美）
死者：
1．青桐嶽人，被三名死者惡作劇掉下樓摔死
2．斧田鏡壹郎，先被兇手用刀刺死，後被冬部蒼介在胸口插入吸血櫻
3．繪冬千夏，先被兇手用刀刺死，後被冬部蒼介處理了屍體
4．冬部蒼介，被兇手刺傷後，自己用吸血櫻插入胸口自殺
人偶島殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，五木陽介
兇手：星阪花梨
死者：
1．弓月時雨，因丈夫的罪行被朱鷺田忍寫入小說不堪羞辱而自殺
2．朱鷺田忍，分屍
動畫原創事件：
原創第壹案：悲嘆之鬼面殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，如月美和
兇手：辻口美奈子，江波勝彥
死者：
1．鬼頭小百合，被兩位死者和岡安俊秀做惡作劇導致摔下懸崖
2．中野宏和，辻口美奈子殺死後被江波勝彥發現，放跑辻口美奈子之後自己藏於密室中，後辻口美奈子引開大家而逃脫
3．阪本裕子，被江波勝彥殺死後放上舞臺
原創第二案：出雲傳說殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，金田壹二三，劍持勇
兇手：坤田友代，白井虎太郎
死者：
1．乾英基，被白井虎太郎開槍擊中後掉入湖中
2．朱雀齊助，刺死，兇手逃離
3．青山龍子，燒死於舞臺後面
4．白井虎太郎，被兇手誘導至巖洞後殺死
5．坤田友代，病逝 歌劇院新殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：能條光三郎
死者：
1．黑澤美歌，被三名被害人迫害而自殺
2．能條聖子，勒死後被吊燈砸中
3．綠川遊紀夫，勒死
4．瀧哲厚，勒死
幽靈客船殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：香取洋子（鹿島洋子）
死者：
1．鷹守鄉三，刀刺死後拋屍於大海
2．若王子幹彥，毒殺
3．加納哲也，毒殺
4．赤井義和，從懸崖上摔下（小說中未死）
鬼火島殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇
兇手：椎名真木男
死者：
1．森村圭壹，勒死
2．加藤賢太郎，勒死
上海魚人傳說殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，李波兒，楊小龍
兇手：楊麗俐（小林千惠）
死者：
1．小林哲治，被三名死者偷車時撞死
2．楊王，槍殺（自殺）
3．唐人美，槍殺
4．藤堂壯介，槍殺
雷祭殺人事件
兇手：朝木葉月，朝木時雨
死者：
1．朝木冬生，被朝木葉月用掏火棍刺穿脖子
2．武藤恭壹，給朝木春子打傷後，被朝木時雨用煙灰缸敲中太陽穴
3．朝木時雨，病逝
電腦山莊殺人事件
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇（結尾處出現）
兇手：阿瑟（琢磨）
死者：
1．阿瑟，刀刺，被兇手交換身份
2．僧正（貴誌日出），刀刺
3．史賓塞（飯田文江），勒死
4．亂步（辰巳哲），刀刺
5．瑪麗亞（淺香奈奈），毒殺
殺戮之深藍
主角：金田壹壹，七瀨美雪，劍持勇，明智健悟，楊小龍
兇手：“西薩王”三井文也動畫：遠堂由明（那國直人），葛林（新堂雄壹），雷德（宮垣建也）
死者：
1．那國守彥，病逝
2．藍澤由裏繪，被葛林槍殺
3．藍澤剛，被“西薩王”殺死
4．藍澤優，被“西薩王”殺死
5．葛林（新堂雄壹）和雷德（宮垣建也），因為西薩王的挑撥離間自相殘殺（動畫中未死）
6．三井文也，揭穿真相後，自己打破玻璃被海水淹死
邪宗館殺人事件
兇手：常葉瑠璃子
死者：
1．荒木比呂，重擊頭部
2．繪馬龍之介，毒死
舊版兇手在解密後狀況
自殺：
有森裕二 都築哲雄 多歧川穗 和田櫻（蒲生櫻） 檜山達之 小野寺將之
遠野英治（未確定死亡） 他殺： 六星龍壹 的場勇壹郎 巽紫乃 速水雄壹郎 近宮玲子 安岡真奈美 逮捕： 綾辻真理奈 佐伯航壹郎 北見蓮子 淺野遙子 森下麗美 鳥丸奈緒子 意外： 小城拓也 村西彌生 逃脫： 高遠遙壹
放棄：
遠野英治（疑似，不能確定深山日影就是遠野）