1、概念不同
臨床藥學：臨床藥學專業是2008年教育部審批設置的專業。臨床藥學是研究藥物防病治療的合理性和有效性的藥學學科。它主要內容是研究藥物在人體內代謝過程中發揮最高療效的理論與方法。它側重於藥物和人的關系，直接涉及到藥物本身，
用藥對象和給藥方式，因此也直接涉及到醫療質量。臨床藥學（ClinicalPharmacy）集數學、物理、化學、生物學等所謂“經線學科”自編成“緯線學科”，或曰：“橫斷學科”。
藥學：藥學專業（Pharmacy）是培養具備藥學學科基本理論、基本知識和實驗技能，能在藥品生產、檢驗、流通、使用和研究與開發領域從事鑒定、藥物設計、壹般藥物制劑及臨床合理用藥等方面工作的高級科學技術人才的學科。
藥學專業業務培養要求：本專業學生主要學習藥學各主要分支學科的基本理論和基本知識，受到藥學實驗方法和技能的基本訓練，具有藥物制備、質量控制評價及指導合理用藥的基本能力。
2、課程不同
臨床藥學：大學英語、高等數學、數理統計、醫用物理學、基礎化學、分析化學、有機化學、生物化學與分子生物學、寄生蟲與微生物學、天然藥物化學、藥物化學、藥物分析、人體系統解剖學、藥理學、藥劑學、臨床藥物代謝動力學、
細胞生物學、藥物毒理學、病理學、生理學、病理生理學、診斷學、內科學、外科學、婦產科學、兒科學、臨床見習、臨床藥理學、臨床藥物治療學、藥物不良反應與藥物警戒、藥物經濟學、醫院藥事法規與GCP、醫學倫理學、藥學信息檢索等。
藥學：馬克思主義基本原理、思想道德修養、法律基礎、大學英語、高等數學、醫用物理學、計算機基礎、形態學概論、生理學、細胞生物學、分子生物學、醫學免疫學、病理生理學、醫學微生物學、無機化學、有機化學、生物化學、定量分析、
儀器分析、物理化學、基礎化學實驗、藥物化學、天然藥物化學、藥劑學、藥物分析、藥理學、毒理學基礎、藥物的波譜解析、藥事管理學、專業技能實驗等。
3、核心能力不同
臨床藥學：基礎醫學、臨床醫學和藥學的基本理論知識；臨床合理用藥與安全用藥的基本理論知識；體液中藥物濃度測定的原理、方法與實驗技能；藥及藥物新劑型、新制劑的臨床藥理觀察與評價的初步能力。
藥學：掌握藥劑學、藥理學、藥物化學和藥物分析等學科的基本理論、基本知識；掌握主要藥物制備、質量控制、藥物與生物體相互作用、藥效學和藥物安全性評價等基本方法和技術；
具有藥物制劑的初步設計能力、選擇藥物分析方法的能力、新藥藥理實驗與評價的能力、參與臨床合理用藥的能力；熟悉藥事管理的法規、政策與營銷的基本知識；了解現代藥學的發展動態；掌握文獻檢索、資料查詢的基本方法，具有壹定的科學研究和實際工作能力。
4、就業方向不同
臨床藥學：臨床藥學專業的畢業生，其就業方向主要在各級醫療單位、醫學院校從事臨床藥學教育、藥品流通、藥品不良反應監測、藥品鑒定與研發、藥品服務與管理等工作。
藥學：藥學成人高考專業的畢業生具有較全面的綜合素質和較強的持續發展能力，畢業後能夠從事與藥物合成、藥物制劑、藥物檢驗、藥品生產與營銷、新藥研制開發與質量控制等工作以及與藥學研究、管理和教學有關的工作。
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