新農合出院報銷是有時間限制的，要求在出院10日內辦理報銷手續，醫院結算直接結算的。參合人員在報銷未及時結報住院醫療費用，應在出院後3個月內持相關資料到戶籍所在地 鎮（街道）農醫辦辦理報銷手續。當年發生的醫療費原則上在次年的1月底前必須結清。如遇特殊情況經村、鎮兩級證明可延遲到次年的2月底，逾期不再辦理報銷手續。所以還是盡快辦理比較好。農村合作醫療制度是由政府支持、農民群眾與農村經濟組織***同籌資、在醫療上實行互助互濟的壹種具有醫療保險 性質的農村健康保障制度。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》
第二條 國家建立基本養老保險、基本醫療保險、工傷保險、失業保險、生育保險等社會保險制度,保障公民在年老、疾病、工傷、失業、生育等情況下依法從國家和社會獲得物質幫助的權利。
第二十六條 職工基本醫療保險、新型農村合作醫療和城鎮居民基本醫療保險的待遇標準按照國家規定執行。
第二十八條 符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。
《關於加快推進新型農村合作醫療 試點工作的通知》第壹條 高度重視新型農村合作醫療試點工作建立新型農村合作醫療制度，是從我國基本國情 出發，解決農民看病難問題的壹項重大舉措，對於提高農民健康水平、緩解農民因病致貧、因病返貧、統籌城鄉發展、實現全面建設小康社會 目標具有重要作用。各有關部門要從執政為民、以人為本和建設和諧社會的高度，充分認識開展新型農村合作醫療試點工作的重大意義，按照國務院的部署和要求，統壹思想，明確目標，精心組織，紮實工作，把這項造福廣大農民的大事抓緊、抓實、抓好。各省（區、市）相關部門要認真組織開展調查研究，完善試點方案，規範運作機制，形成2～3種比較成熟的試點模式，供今後推廣時借鑒。