(1)基礎培養基。它是壹種培養基，含有壹般微生物生長和繁殖所必需的基本營養物質。牛肉膏蛋白腖培養基是最常用的基本培養基。
(2)豐富培養基。它是在基本培養基中加入血液、血清和動植物組織提取物制成的培養基。用於培養壹些要求嚴格的微生物。
(3)培養基的選擇。在普通培養基中加入特殊的營養物質或化學物質，抑制不需要的微生物生長，促進需要的微生物生長。用於從混合微生物群體中分離某種微生物或某種類型的微生物。使用培養基的原因是加入青黴素分離酵母，黴菌等真菌只作用於細菌，對真菌沒有作用。金黃色葡萄球菌細胞壁致密，能分泌血漿凝固酶，將纖維蛋白原分解成纖維蛋白，沈積在細胞壁表面形成厚厚的不透膜。固氮菌在沒有氮源的情況下不容易失水。固氮菌可以利用空氣中的氮，而其他真菌不能利用含碳有機物分離自養微生物。自養微生物可以利用無機碳源，異養微生物不能添加青黴素等抗生素來分離導入了目的基因的受體細胞。導入了靶基因的受體細胞含有標記基因，並加入氨基蝶呤以抵抗特定的抗生素。次黃嘌呤和胸苷核苷酸對雜交瘤細胞的分離在本實驗獲得的細胞中，只有雜交瘤細胞能夠完成DNA復制並正常分裂，其他細胞由於其DNA復制過程被阻斷而不能分裂(4)鑒定培養基。就是在培養基中加入壹些試劑或者化學物質，培養後進行壹些改變，從而區分不同類型的微生物。如用於鑒定大腸桿菌的曙紅亞甲藍培養基和用於鑒定纖維素分解菌的剛果紅培養基。
曙紅亞甲藍培養基:用於鑒定大腸桿菌。右圖是大腸桿菌的菌落，菌落表面有反光和金屬感。