1． 生產基因工程藥品
（1） 用基因工程方法生產的“工程菌”可以高效率地生產出高質量，低成本的藥品。
①用大腸桿菌生產的胰島素：治療糖尿病的特效藥。
②用大腸桿菌及酵母菌生產的幹擾素：抗病毒的特效藥。其化學本質為糖蛋白。
③乙肝疫苗：將乙肝病毒中的有關基因分離出來，引入細菌的細胞中，再采用發酵的方法，或者引入哺乳動物的細胞中，再采用細胞培養的方法，就能讓細菌或哺乳動物的細胞生產出大量的疫苗。
（2）我過自行生產的幾種基因工程藥品：白細胞介素-2，幹擾素，乙肝疫苗。人生長激素等。
2．用於基因診斷和基因治療
（1）基因診斷：
①概念：用放射性同位素（如32P），熒光分子等標記的DNA分子做探針，利用DNA分子雜交原理，鑒定被檢測標本的遺傳信息，達到檢測疾病的目的。
②DNA探針：是單鏈的。作用是從基因文庫中準確地提取出目的基因。由於DNA雙鏈的核苷酸序列是彼此互補的，當DNA分子雜交時首先將雙鏈DNA加熱或升高PH值，使雙鏈解開，根據所需的核苷酸序列制成壹段與之互補的核苷酸短鏈，並用同位素標記，即成為探針。用這壹探針查基因文庫中已變性的DNA 片段，如果有壹個DNA片段能和探針片段互補結合而合成雙鏈（分子雜交），說明這壹片段即含有所需的基因。
③原理：DNA分子雜交。
④優點：快速簡便。
⑤實例：用β-珠蛋白的DNA探針可以檢測出鐮刀狀細胞貧血癥，用苯丙氨酸羥化酶基因探針可以檢測出苯丙酮尿癥，用白血病患者細胞中分離出的癌基因制備的DNA探針，可以用來檢測白血病。
（2）基因治療：把健康的外源基因導入有基因缺陷的細胞中，達到治療疾病的目的。目前作到的只是引入外源基因使其表達，以補充缺失的或失去正常功能的酶，而不能作到用正常基因去替換突變的基因。
（二）基因工程與農牧業，食品工業
1．農業方面：
（1）通過基因工程技術獲得高產，穩產和具有優良品質的農作物。
（2）用基因工程的方法培育出具有各種抗擬性的作物新品種。如抗蟲，抗病毒，抗除草劑，抗鹽堿，抗幹旱，抗高溫等。
2．牧業方面：利用基因工程技術培育具有抗病能力，高產仔率，高產奶率和高質量皮毛的動物等
3．食品工業：開辟新的食物來源。用微生物來生產人類所需要的營養物質。
（三）基因工程與環境保護
1．環境檢測：如用DNA探針可以檢測飲用水中病毒的含量，特點是快速，靈敏，精確。
2．環境凈化：科學家用基因工程的方法培育出了能同時分解四種烴類化合物的“超級細菌”以及“吞噬”汞和降解土壤中DDT的細菌，還有能夠凈化鎘汙染的植物等。