疾控中心作為衛生健康部門直屬事業編制單位，接受各級衛生健康局的領導。國家疾病預防控制局隸屬於國家衛生健康委員會，具有副部級建制，下設10個內設機構，負責疾病預防控制等工作。各級疾控中心負責具體的疾病預防控制工作，包括傳染病預防控制、突發事件應急處置等。此外，還設有規劃、財務與法規、監測與預警、應急、傳染病防控、衛生與免疫規劃等職能部門。縣級也將設立疾控局，加強疾病預防控制工作，推進疾控中心標準化建設。
衛生計生部門職能：
1.負責制定公共****、衛生政策和標準，並監督實施；
2.組織開展疾病預防控制和健康促進活動；
3.負責醫療衛生服務體系建設和管理；
4.指導和監督食品藥品安全工作；
5、負責衛生應急管理和醫療救援工作；
6、組織實施人口健康信息統計和衛生科研工作；
7、負責制定醫療保障政策並監督實施；
8、指導衛生與健康人才隊伍建設和繼續教育工作。
綜上所述，疾控中心作為國家衛生健康委直屬副部級事業單位，由各級衛生健康局牽頭，下轄10個內設機構，主要承擔疾病預防控制任務，涵蓋傳染病防控、應急處置等多項職能，並在縣級設立疾控局，以強化工作落實，促進工作規範，確保群眾****、健康和安全。
法律依據：
《傳染病防治法》
第三十五條
疾病預防控制中心是政府舉辦的實施國家疾病預防控制和公共****、衛生技術管理與服務的公益性事業單位。
其使命是通過防病、防殘、防傷，創造健康環境，維護社會穩定，保障國家安全，促進人民健康；其宗旨是以科研為依托，以人才為根本，以疾病控制為中心。在國家衛生健康委員會的領導下，發揮技術管理和技術服務職能，圍繞國家疾病預防控制的重點任務，加強疾病預防控制策略和措施的研究。