主要依托各地有資質的接種單位和接種人員開展甲型流感疫苗H1N1的接種工作。必要時，縣級衛生行政部門可在醫療機構或學校等集體單位設立臨時接種點，並安排足夠數量的合格接種人員。臨時接種點應當具備與接種對象數量相適應的疫苗儲存和接種基本條件，候診室、預診室和接種室應當分開設置，並有明顯標誌。接種現場應備有腎上腺素等急救藥品和其他搶救設施，以應對現場出現的嚴重不良反應。
(2)疫苗管理。
各級疾病預防控制機構和接種單位在接收甲型流感疫苗H1N1時，應當進行檢驗，審核疫苗生產企業和疫苗批發企業的資質，並取得藥品檢驗機構依法出具的每批生物制品復印件，超過疫苗有效期2年的保存備查。
縣級以上疾病預防控制機構要按照《全國疫苗和註射器信息網絡報告管理工作方案》的要求，在互聯網上報告甲型流感疫苗H1N1信息，加強疫苗和註射器出入庫登記管理，確保賬實相符。
(3)冷鏈管理。
甲型流感疫苗H1N1應在2 ~ 8℃避光保存和運輸，以防凍結。
各級疾病預防控制機構和接種單位要嚴格按照《疫苗儲存運輸管理規範》的要求，做好甲型流感疫苗H1N1儲存、運輸、使用各環節的冷鏈儲存和運輸，做好溫度監測。
(4)疫苗接種實施。
甲型H1N1流感疫苗接種應按照《疫苗流通和預防接種管理條例》和《預防接種工作規範》的要求進行，堅持“知情同意、自願免費接種”的原則，嚴格控制接種禁忌癥。各級疾病預防控制機構要加強對預防接種工作的指導。
預防接種工作人員應當在接種前向受種者或者監護人告知疫苗的品種、作用、禁忌癥、不良反應和註意事項，並詢問受種者的健康狀況；無禁忌癥的對象知情同意後方可進行接種；接種疫苗時，要嚴格執行預防接種安全註射，做到壹人壹針壹管；接種後觀察該部位30分鐘。為防止群體性歇斯底裏，在開展群體性預防接種時，應合理安排，避免多個受種者在同壹時間同壹地點接種。