1．藥物不良反應發生的原因：藥物種類繁多，用藥途徑不同，體質又因人而異。因此， 藥物不良反應發生的原因也是復雜的。
（1）藥物方面的原因：
1）藥理作用：很多藥物在應用壹段時間後，由於其藥理作用，可導致壹些不良反應， 例如，長期大量使用糖皮質激素能使毛細血管變性出血，以致皮膚、粘膜出現瘀點，瘀斑，同時出現類腎腺上皮質功能亢進癥。
2）藥物的雜質：藥物生產中可能混入微量高分子雜質，亦常滲入賦形劑等，如膠囊的染料常會引起固定性皮疹。青黴素過敏反應是因制品中含微量青黴素烯酸、青黴素噻唑酸及青黴素聚合物等物質引起的。
3）藥物的汙染：由於生產或保管不當，使藥物汙染，常可引起嚴重反應。
4）藥物的劑量：用藥量過大，可發生中毒反應，甚至死亡。
5）劑型的影響：同壹藥物劑型不同。由於制造工藝和用藥方法的不同，往往影響藥物的吸收與血中藥的濃度，亦即生物利用度有所不同，如不註意掌握，即會引起不良反應。
6）藥物的質量問題：同壹組成的藥物，可因廠家不同，制劑技術差別、雜質的除去率不同，而影響其不良反應的發生率。如冠心平中的不純物對氯苯酚則是發生皮炎的原因。氨芐青黴素中的蛋白質則是發生藥疹的原因等。
（2）機體方面的原因：
1）種族差別：在人類白色與有色人種之間對藥的感受也有相當的差別。甲基多巴所誘發的溶血性貧血在不同種族間的發生率是不同的。如進行直接抗球蛋白試驗時，服用此藥的高加索人則15%出現陽性，而服用此藥的印第安人和非洲人以及中國人都未發生陽性。解熱消炎劑異丁苯酸在英國則多出現損傷，而在日本則比較少見等。
2）性別：在藥物性皮炎中，男性發病者多於女性，其比率約為3：2。西咪替丁可引起男性乳房發育。保泰松和氯黴素導致的粒細胞缺乏癥，婦婦女比男性高3倍，氯黴素引起的再生障礙性貧血則為2倍。據Hurtwity報告：不良反應男性發生率占7.3%(50/682)，女性則為14.2%(68/478)。
3）年齡：老年人、少年、兒童對藥物反應與成年人不同，例如青黴素，成年人的半衰期為0.55小時，而老年人則為1小時，老年人由於血漿蛋白濃度減少，與藥物結合能力也降低，如苯妥英鈉與血漿蛋白的結合率較45歲以下的人低26%，小兒對中樞抑制藥，影響水鹽代謝及酸堿平衡的藥物均較敏感。壹般地說，乳幼兒較成人易發生不良反應的原因有：藥物代謝速度較成人慢，腎排泄較差，作用點上藥物作用的感受性較高，且易進入人腦內等。據統計，不良反應發生率，60歲以下者為6.3%1（42/667），而60歲以上者為5.4%（76/493），老年人使用洋地黃及利血平等尤應註意。
4）個體差異：不同個體對同壹劑量的相同藥物有不同反應，這是正常的“生物學差異”現象。例如，對水楊酸鈉的不良反應就是個體差異。300例男性病人用水楊酸鈉治療，約有2/3的病人在總量為6.5~13.0g時發生不良反應，但在總量僅為3.25g時，已有不數病人出現反應，也有個別病人在總量達30.0g左右時才出現反應，引起反應的劑量在不同個體中相差可達10倍。有時，個體差異也影響到藥物作用的性質，例如巴比妥類藥物在壹般催眠劑量時，對大多數人可產生催眠作用，但對個別人不但不催眠甚至引起焦躁不安、不能入睡。嗎啡也有類似情況，對個別人不表現抑制作用，而是興奮作用。前述之過敏反應和特異質即是個體差異的表現。
5）病理狀態：病理狀態能影響機體各種功能，因而也能影響藥物作用。例如腹瀉時，口服藥的吸收差，作用小。肝腎功能減退時，可以顯著延或加強許多藥物的作用，甚至引起中毒。
6）血型：據報告，女性口服避孕藥引起血栓癥，A型較O型者多。
7）營養狀態：飲食的不平衡亦可影響藥物的作用，如異煙肼引起的神經損傷，當處於維生素B6缺乏狀態時則較正常情況更嚴重。對缺乏煙酸飼養的動物，當用硫噴妥鈉麻酔時，作用增強。