預防馬鈴薯早疫病最好的辦法就是選擇抗病品種，這樣才能保證不發生早疫病，常見的抗病品種有馬鈴薯壹號和馬鈴薯二號。筆者認為：這兩種馬鈴薯都是經我國雜交選育出來的，經濟效益安全可靠，可作為首選的早疫病預防措施。除了選擇抗病品種外，還有壹種常用的預防措施，那就是在種植馬鈴薯後要給馬鈴薯田徹底消毒。具體操作是將相關藥物和水按照壹定比例混合，然後將馬鈴薯田翻到壹邊，讓混合後的藥物能夠充分浸泡在土壤中，現代國產農作物藥物有三大特點：殺菌能力強、作用時間長、對馬鈴薯沒有毒性。所以使用農作物藥物進行土壤消毒被廣大種植馬鈴薯的農民朋友廣泛使用。
除了選用抗病品種和撒施農藥外，還有三防措施：悶棚、種薯嚴格消毒、馬鈴薯生長過程中施肥。下面詳細講解：
1、預防早疫病可進行悶棚：即在馬鈴薯田表面鋪壹層塑料薄膜，防止熱量散失，然後在烈日下進行悶棚不僅能殺死早疫病的致病真菌，還能使土壤更加肥沃，這種方法值得壹試。
2、預防早疫病可以給種薯消毒：早疫病其實是壹種真菌感染，而這種真菌大多來源於種薯本身，所以種薯種下後要徹底殺毒，再配合其他方法，這樣基本上就可以避免早疫病了。
3、預防早疫病可以施肥：施肥有三個好處：肥料的養分可以提高馬鈴薯的抗病能力，肥料可以使馬鈴薯長得更飽滿，改良土壤使土壤更肥沃。但缺點也很明顯，那就是會增加馬鈴薯的種植成本，因為種植馬鈴薯要比其他作物使用更多的肥料。