1985年，推出了世界上首個以油菜花粉為原料，治療前列腺增生的藥物——前列康。1989年，“前列康”榮獲第32屆國際養蜂大會和第22屆國際蜂產品博覽會集體金獎 。
1990年5月10日，雲山制藥廠新廠建成並完成搬遷。11月14日，雲山制藥廠正式更名為康恩貝制藥公司，並在全國醫藥行業和浙江省首家實施了企業形象識別系統（CIS），“康恩貝”品牌正式誕生。
1990年，開發出了另壹個重要產品——銀杏葉提取物，在國內第壹家推出並出口國際市場。
1992年，國內首個符合國際標準的現代植物藥——銀杏葉片正式獲得批準。1993年始，康恩貝在杭州建立了處方藥營銷部，成為中國較早進行處方藥學術推廣的醫藥企業，建立了第壹支處方藥推廣隊伍。
1993年，天保寧牌銀杏葉膠囊作為首個銀杏葉提取物新藥獲得衛生部新藥證書。
1993年，康恩貝成為省內首批36家現代企業制度試點企業之壹。
1994年5月，康恩貝總部由蘭溪遷往杭州，康恩貝集團成立，成為省內首個總部遷杭的企業，由此引發了浙江省企業總部遷都的風潮。
1994年，康恩貝收購了浙江鳳凰，開創非上市公司收購上市公司的先河。
1996年9月，通過競爭收購了陷入困境的金華最大的國有企業——金華制藥廠，1997年就扭虧為盈，2000年後重新成為金華市的市屬骨幹企業，多年來金華康恩貝的納稅壹直名列金華市本級所有工業企業前兩位。
2000年，成立了英諾琺的前身——迪佳公司，壹個新的品牌“金奧康”誕生，成為康恩貝旗下又壹個知名的品牌，在浙江市場成為消化領域的第壹品牌。
2000年，康恩貝開始啟動IPO，2004年4月12日正式在上海證交所上市。
2002年，在杭州組建了首個省級民營藥品研究機構——浙江現代中藥與天然藥物研究院。
2003年，康恩貝在國內較早與歐洲跨國制劑技術研發集團Ethypharm合作，***同建立了中藥研發中心，建立國家制劑工程中心浙江分中心、中科院成都有機所浙江手性藥物研發中心。
2004年，康樂大寶素獲得新生，元邦牌康樂大寶膠囊成功登陸市場，通過四年時間的努力，成為浙江省男用保健品市場的第壹品牌。
2004年8月，康恩貝全面啟動了前列康大品牌戰略，刮起了前列康“8.28颶風行動”，被評為當年中國醫藥十佳營銷案例。
2006年，康恩貝股票實現全流通，並於2007年9月通過非公開發行股票方式使金華康恩貝間接上市。
2008年，省內最大的植物藥產業基地——康恩貝（蘭溪）現代植物藥產業園整體竣工並壹次性通過GMP認證。
2008年，在浙江省中藥行業首個獲得國家認定企業技術中心資格，同期，獲國家人力資源和社會保障部批準成立國家級博士後科研工作站，這也是省內中藥企業中首個獲批成立的國家級博士後工作站。
2009年，浙江天保藥材發展有限公司在蘭溪成立，植物藥板塊產業鏈延長到藥用植物的種植。
2009年，推出康恩貝高山鐵皮，並在雲南設立鐵皮種植基地。
2010年，分別成立江西龍虎山丹霞養生谷有限公司、雲南康恩貝生物谷發展有限公司，正式進軍健康養生、生物農業範疇。
2010年10月18日，“康恩貝”品牌創立二十周年紀念活動順利舉行，也是康恩貝開創品牌經營新時代的起點。
2010年，杭州康恩貝生物科技產業發展基地奠基儀式正式開始。
2012年8月3日，“康恩貝金蘭大健康產業帶雙百億工程”啟動，標誌著康恩貝集團回歸金華、打造浙江生物醫藥和大健康產業龍頭企業的核心工程拉開序幕。
2012年，金華康恩貝的“硫酸阿米卡星”和“註射用硫酸阿米卡星”產品被列入中國衛生部——蓋茨基金會結核病防治項目，支持WHO為非洲國家藥品的全球采購工作。目前，硫酸阿米卡星產品已於2012年9月經過WHO官員的現場預審計。