（1）根據原料來源分類
①無機農藥 由礦物原料加工制成的農藥。如硫制劑的硫磺、石灰硫磺合劑；銅制劑的硫酸銅、波爾多液；磷化物的磷化鋁等。
②生物源農藥 壹類是植物性農藥，是用天然植物加工制成的，所含有效成分是天然有機化合物，如除蟲菊、煙草等。另壹類是微生物農藥，是用微生物及其代謝產物制成的，如BT乳劑等。生物源農藥具有對人、畜安全，不汙染環境，對天敵殺傷力小和有害生物不會產生抗藥性等優點，是生產無公害果品大力推廣的農藥品種。
③有機合成農藥 即人工合成的有機化合物農藥。這類農藥的特點是藥效高、見效快、用量少、用途廣，可適應各種不同的需要，但是汙染環境，易使有害生物產生抗藥性，對人、畜不安全。
（2）根據防治對象分類
①殺蟲劑 用來防治有害昆蟲的化學物質。目前常用的殺蟲劑主要是有機磷和菊酯類殺蟲劑。
②殺蟎劑 用來防治蟎類及其卵的化學物質。
③殺菌劑 用來防治病原微生物的化學物質。
④除草劑 用來防除農田雜草的化學物質。
⑤殺鼠劑 用來防治農田害鼠的化學物質。
⑥植物生長調節劑 用來促進或抑制農林作物生長發育的化學物質。
（3）根據農藥的作用方式分類
①殺蟲、殺蟎劑
觸殺劑：藥劑接觸害蟲，通過體壁及氣門進入害蟲、害蟎體內，使之中毒死亡。
胃毒劑：藥劑通過害蟲取食而進入其消化系統，使之中毒死亡。
內吸劑：藥劑被植物的莖、葉、根和種子吸收而進入植物體內，並在植物體內傳導擴散，或產生更毒的代謝物，使取食植物的害蟲中毒死亡。
熏蒸劑：藥劑在常溫下化為有害氣體，通過呼吸系統進入害蟲體內，使之中毒死亡。
昆蟲生長調節劑：藥劑阻礙害蟲的正常生理功能，阻止正常變態，使幼蟲不能變蛹或蛹不能變成蟲，形成沒有生命力或不能繁殖的畸形個體。
②殺菌劑
保護劑：在植物發病前或發病初期，將藥劑均勻覆蓋在植物體表，消滅病原微生物或防止病原微生物擴展蔓延。
治療劑：植物發病後施用，這類藥劑通過內吸進入植物體內，傳導至未施藥的部位，對植物體內病原微生物產生毒性，抑制或消滅病原微生物，使病株不再受害，恢復健康，因而具有保護劑達不到的治療效果。
③除草劑
選擇性除草劑：這類除草劑對作物的毒性和防除雜草的種類是有選擇性的，它可分兩大類，壹類是單子葉除草劑，另壹類是雙子葉除草劑。
滅生性除草劑：這類除草劑對植物缺乏選擇性，或選擇性很小，能殺死絕大多數綠色植物。