2006年是深航發展史上具有裏程碑意義的壹年，是深航實施 "369 "戰略發展規劃的第壹年，也是深航在安全、效益、服務、發展等方面取得顯著成績的壹年。深航確立了發展戰略，形成了文化體系，進行了壹系列組織創新、管理創新、機制創新和服務創新，實施了人才引進和培養計劃，建立了壹個模擬機訓練基地、三個員工培訓中心，與高校合作建立了三個研究基地。2007年，深航在集團 "創深航羅盤管理模式，建五星級航空運輸企業，做特色航空領跑者 "的目標指引下，按照 "壹個主體、兩個支撐、三大業務、三大板塊 "的原則，進壹步加快發展步伐，提升發展質量。按照集團 "壹個主體、兩個支撐、三大主業、四大板塊 "的業務發展規劃，發展價值鏈和服務鏈產業群，以客運為主體，客貨並舉，實施深航 "369 "計劃，著力推進信息化和資產運營平臺建設，實現貨運、支線、公務航空****，全力推進深航 "369 "計劃發展。公司還大力發展機場、酒店旅遊、房地產、飛機租賃等與主業相關的產業板塊，實施品牌經營戰略，構建蛛網型航線網絡，形成了以企業文化為旗幟、以羅盤管理為支撐的 "三高壹低 "核心競爭力，提前壹年實現了 "369 "計劃。"2005-2007年，深航主要生產經營指標年均增長40％以上，近兩年的發展超過了前13年的總和，2007年實現利潤6.4億元，比上年增長76．76.8%.
深航以 "立誌成為全球最受尊敬、最有價值的航空公司，推動民族航空公司成為世界首選 "為使命，以成為 "特色航空領跑者 "為願景，向世界展示了企業的追求和責任。在中國民航由民航大國向民航強國發展的進程中，公司貢獻著自己的力量。