慢性胃炎的藥物治療方面主要可包括以下四類，患者應根據病因遵醫囑進行治療：
1、質子泵抑制劑治療。質子泵抑制劑可通過特異性地作用於胃黏膜壁細胞，使H+/K+-ATP質子泵失活，從而達到抑制胃酸分泌的作用，是目前抑酸作用比較強的壹類藥物，常用的如奧美拉唑、雷貝拉唑等。
2、膠體鉍劑類藥物。此類藥物由於其膠體特性可在酸性環境下與黏膜滲出的蛋白結合在壹起，在胃黏膜上形成牢固的保護膜，並通過鉍離子對幽門螺桿菌產生殺滅作用，從而發揮黏膜保護作用，常用的制劑有膠體堿式枸櫞酸鉍等。
3、抗生素類藥物。抗生素類藥物主要是殺菌，要求在酸性環境中不失去活性，保持穩定，能穿過黏液層在局部達到有效殺菌濃度。常用的有阿莫西林、克拉黴素等。
4、消化酶類藥物。Hp感染的慢性胃炎患者由於長期使用質子泵抑制劑治療，導致胃腸道內胃酸分泌失調，消化酶活性不足，多伴隨腹脹、惡心、噯氣等消化不良癥狀，因此患者可遵醫囑，在慢性胃炎治療的基礎上，補充消化酶如米曲菌胰酶片等制劑，既能通過補充高活性的米曲菌酶提取物和胰酶，快速緩解消化不良癥狀，又能加強患者營養吸收，幫助疾病康復。
除了藥物治療以外，慢性胃炎患者還應註意改善生活方式，規範飲食習慣，盡量避免化學藥品對胃的刺激，調暢情誌、改善環境，輔助治療減少病因對胃黏膜的刺激，以利於病情的好轉。