醫院藥品的出入庫、領用、消耗、結存等都要按數量、單價金額記賬，並且都統壹按零售價進行核算，便於準確計算藥品的經驗成果。2、數量統計。在HIS系統下，醫院的全部藥品無論是入庫、出庫、領用、銷售、庫存都要進行數量統計，期末，計算機可以對藥品的購進、發出和結余進行自動匯總，藥品的實物數量與計算機中的結余數量核對無誤，從而真正做到藥品的科學管理。3、實耗實銷。在HIS系統下，藥房根據計算機自動匯總出的門診處方和住院的長期醫囑和臨時醫囑中實際消耗的藥品的銷售額向財務部門結算，改變了以領代銷和以存代銷的核算模式，真正做到實耗實銷，確保賬實相符。二、HIS系統下藥品“零庫存”具體做法利用醫院HIS系統，住院及門診各藥房可以根據藥品發出的實際情況統計出藥品的實際消耗，並按藥品品種逐個確定藥房需求的最高和最低限值，據此，各藥房上傳采購計劃至藥庫，藥庫接收到采購計劃信息後，及時安排采購；藥品購入醫院後，藥庫根據各藥房上傳的采購申請，快速、全額發放藥品，從而實現藥庫的“零庫存”；藥品調撥到藥房後，可以很快發放到病人手中，從而大大加快了藥品的流通速度，有效地減少了藥品的積壓和資金的占用。醫院的各藥房可以通過領藥入庫表、庫存表、消耗表、出庫表、損益表和缺藥報警、有效期報警以及處方查詢、退藥查詢等報表來實現全面控制，嚴格控制到每壹種藥品，甚至每壹個批號。有了實時、準確的數據依據，輔以嚴格的管理制度如藥品分類分櫃管理、值班數量核查責任制、不定期數量抽查、定期盤存等，再配合財務管理手段，從而真正做到藥品全面管理。另外，運用HIS系統的查詢和統計功能，藥庫可以及時、準確的掌握藥品進出情況，統計庫存藥品，通過對數據的綜合分析，可以得出暢銷藥品、滯銷藥品、積壓藥品、過期藥品、損耗藥品、醫生用藥偏好等壹系列有意義的數據，為醫院領導決策提供更多有用的信息。因而做好對藥品品種、批次、價格、包裝單位的清理，加強會計基礎工作如原始憑證、審核簽章等就顯得非常必要，另外還必須強化對付款憑證、月末結轉、財務對賬的管理，做好財務核對和付款準備工作，為藥品流通提供有力保障。