醫療行業常見的滅菌方法：輻射滅菌法、幹熱滅菌法、濕熱滅菌法、氣體滅菌法、過濾除菌法、環氧乙烷滅菌法和臭氧滅菌法。
輻射滅菌法指滅菌物品置於適宜放射源輻射的γ射線或適宜的電子加速器發生的電子束中進行電離輻射而達到殺滅微生物的方法。醫療器械、容器、生產輔助用品、不受輻射破壞的原料藥及成品等均可用本法滅菌。
幹熱滅菌法指將物品置於幹熱滅菌櫃、隧道滅菌器等設備中，利用幹熱空氣達到殺滅微生物或消除熱原物質的方法。適用於耐高溫但不宜用濕熱滅菌法
滅菌的物品滅菌，如玻璃器具、金屬材質容器、纖維制品、固體試藥、液狀石蠟等均可采用本法滅菌。
濕熱滅菌法指將物品置於壓力蒸汽滅菌器內利用高壓飽和蒸汽、過熱水噴淋等手段使微生物菌體中的蛋白質、核酸發生變性而殺滅微生物的方法。該法滅菌能力強，為熱力滅菌中最有效、應用最廣泛的滅菌方法。
過濾除菌法利用細菌不能通過致密具空濾材的原理以除去氣體或液體中微生物的方法。常用於熱不穩定的藥品溶液或原料的除菌。
臭氧滅菌法，臭氧是壹種強氧化劑，滅菌過程屬生物化學氧化反應。
氣體滅菌法指用化學消毒劑形成的氣體殺滅微生物的方法。常用的化學消毒劑有環氧乙烷、氣態過氧化氫、甲醛、臭氧（O3）等，本法適用於在氣體中穩定的物品滅菌。采用氣體滅菌法時，需要註意滅菌氣體的可燃可爆性、致畸性和殘留毒性。
氣體滅菌法最常用的氣體是環氧乙烷，環氧乙烷氣體殺菌力強、殺菌譜廣，可殺滅各種微生物包括細菌芽孢，屬滅菌劑。壹般與 80%~90%的惰性氣體混合使用，在充有滅菌氣體的高壓腔室內進行。
環氧乙烷不會損害滅菌的物品且穿透力很強，壹般可用於醫療器械，塑料制品等不能采用高溫滅菌的物品滅菌。例如，電子儀器、光學儀器、醫療器械、書籍、文件、皮毛、棉、化纖、塑料制品、木制品、陶瓷及金屬制品、內鏡、透析器和壹次性使用的診療用品等。環氧乙烷也是目前最主要的低溫滅菌方法之壹。特別註意的是，含氯的物品以及能吸附環氧乙烷的物品則不宜使用環氧乙烷滅菌法。
采用環氧乙烷滅菌時，滅菌櫃內的溫度、濕度、滅菌氣體濃度、滅菌時間是影響滅菌效果的重要因素。
采用環氧乙烷滅菌時需滿足下列滅菌條件：
溫度 （54±10）℃
相對濕度（60±10）%
滅菌壓力 8*10〈5〉Pa
滅菌時間 90min
滅菌條件應予驗證 滅菌時，將滅菌腔室先抽成真空，然後通入蒸汽使腔室內達到設定的溫濕度平衡的額定值，再通入經過濾和預熱的環氧乙烷氣體。滅菌過程中，應嚴密監控腔室的溫度、濕度、壓力、環氧乙烷濃度及滅菌時間。必要時使用生物指示劑監控滅菌效果。
本法滅菌程序的控制具有壹定難度，整個滅菌過程應在技術熟練人員的監督下進行。滅菌後，應采取新鮮空氣置換， 使殘留環氧乙烷和其他易揮發性殘留物消散。並對滅菌物品中的環氧乙烷殘留物和反應產物進行監控，以證明其不超過規定的限度，避免產生毒性。