目前，臨床使用的抗生素主要有以下幾類:
1，青黴素類:臨床最早使用的抗生素，療效高，毒性低。主要作用是使易感菌的細胞壁異常發育，導致其死亡。人和哺乳動物細胞沒有細胞壁，所以有效抗菌濃度的青黴素對人和哺乳動物細胞沒有影響，所以對人體的副作用較小。臨床常用的青黴素類有:青黴素G、氨芐西林、阿莫西林(阿莫西林、阿莫西林)、苯唑西林等。
2.頭孢菌素類:該類抗生素自60年代應用於臨床以來，發展迅速，應用廣泛。傳統上根據時間和對細菌的作用分為壹、二、三代。常用的有:頭孢氨芐(頭孢噻肟IV)、頭孢唑啉(頭孢噻肟V)、頭孢拉定(頭孢噻肟VI)、頭孢呋辛(頭孢噻肟)、頭孢曲松(羅斯芬)、頭孢噻肟(克福龍)、頭孢哌酮(頭孢哌酮)等。
3.氨基糖苷類:該類抗生素性質穩定，抗菌活性廣，在有氧條件下可殺死敏感菌。其治療指數(治療劑量/毒性劑量)低於其他抗生素，最常見的不良反應是耳毒性。常用的有:鏈黴素、慶大黴素、黴素、阿米卡星等。
4.大環內酯類:這些抗生素都含有壹個碳數為12—16的大環內酯環，屬於抑菌劑，僅適用於輕中度感染，但卻是目前最安全的抗生素之壹。紅黴素作為這壹類的代表，在臨床上應用廣泛，對青黴素過敏的人經常用本品治療。近年來開發了許多新品種，臨床效果顯著，如阿奇黴素(特利特、組胺)、克拉黴素、旋轉黴素、地紅黴素等。常用的有麥迪黴素、螺旋黴素和交沙黴素。
5.四環素類:包括四環素、土黴素和強力黴素。這種抗生素可以沈積在發育中的骨骼和牙齒中。重復使用會導致骨骼發育不良，牙齒發黃，牙釉質發育不良。從妊娠中期到3歲最危險，可持續到7歲甚至更久。所以孕婦、哺乳期婦女、8歲以下兒童禁用。
6.氯黴素:這類抗生素的特點是脂溶性高，易進入腦脊液和腦組織，對多種病原體有效，但可誘發再生障礙性貧血，應用受限。包括氯黴素、琥珀酸氯黴素等。
7.林可酰胺類:包括林可黴素和克林黴素。
8.多肽類和其他抗生素:這類抗生素結構復雜，很難根據其結構特征進行分類，如萬古黴素、多粘菌素E、磷黴素和制黴菌素。
還有壹些臨床上廣泛使用的合成抗菌藥物，主要是磺胺類(磺胺嘧啶、復方磺胺甲惡唑等。)、喹諾酮類(諾氟沙星、氧氟沙星、環丙沙星等。)和其他合成抗菌藥物(呋喃唑酮、甲硝唑、黃連素等。).