食品質量安全管理體系的特點如下：
（1）食品安全管理體系是建立在科學分析基礎上的體系，需要強大的技術支撐，當然也可以尋找外援，吸收和利用別人的科研成果，但最重要的還是企業根據自身情況所做的實驗和數據分析。
（2）食品安全管理體系是壹個需要認真實踐-認識-再實踐-再認識的過程。企業在制定食品安全管理制度時，應積極推行，認真落實，並不斷驗證其有效性，在實踐中不斷完善和提高。
（3）食品安全管理體系是根據不同食品的加工過程來確定的，要體現特定食品從原料到成品、從加工場所到加工設施、從加工者到消費者的方式等各個環節的特點，本著具體問題具體分析的原則，實事求是。
（4）食品安全管理體系不是壹個孤立的體系，而是以企業良好的食品衛生管理傳統為基礎的管理體系。例如，GMP、SSOP、員工培訓、設備維護、產品標簽、批次管理等都是實施食品安全管理體系的基礎。如果企業的衛生條件很差，那麽就不適合實施食品安全管理體系，首先需要建立良好的衛生管理規範。
（5）食品安全管理體系是壹個預防性的食品安全控制體系，要分析所有潛在的生物、物理和化學危害，確定預防措施，防止危害的發生。
（6）食品安全管理體系不是僵化的、壹成不變的、理論教條的、壹勞永逸的模式，而是與實際工作發展密切相關的體系。
（7）食品安全管理體系強調對關鍵控制點的控制，在分析所有潛在的、生物的、物理的和化學的危害的基礎上，確定哪些是重大危害，確定食品生產中的關鍵控制點，將重點放在解決關鍵問題上，而不是放在所有環節上。
（8）食品安全管理體系不是無風險的，只能降低或減少食品安全風險。作為企業，僅有食品安全管理體系是不夠的，還要有相關的檢驗、衛生管理等手段來配合***對食品生產安全的控制。